RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475241.1

PKDCC-204, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, human

TSL 3

Gene PKDCC, Length 773 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKDCC-204	ENST00000475241	OTOR	Q9NRC9	128 aa		12.07	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	LYRM9	A8MSI8	78 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	KLLN	B2CW77	178 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	SUN5	Q8TC36	379 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	C16orf74	Q96GX8	76 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	LYST	Q99698	3801 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241		A0A0D9SG52	128 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	ERCC8	Q13216	396 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	ZNF492	Q9P255	531 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	DIRC3	C9JPN6	131 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	SMLR1	H3BR10	107 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	CXorf1	O96002	111 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	ZNF138	P52744	262 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	KIR3DS1	Q14943	382 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	TMED6	Q8WW62	240 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	VGLL1	Q99990	258 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	C7orf71	A4D174	169 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	PGP	A6NDG6	321 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	AZU1	P20160	251 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	GCHFR	P30047	84 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	FAM210B	Q96KR6	192 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKDCC-204	ENST00000475241	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	12.02	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	GPX1	P07203	203 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241		Q6ZNX1	250 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	IGLL5	B9A064	214 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	PRM2	P04554	102 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	HTN1	P15515	57 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	DAD1	P61803	113 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	RYR3	Q15413	4870 aa		12	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241		J3KRW8	73 aa		12	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	HYLS1	Q96M11	299 aa		12	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	APLN	Q9ULZ1	77 aa		12	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	SEC11B	P0C7V7	166 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	CD300C	Q08708	224 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241		A0A1W2PRE2	83 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	BCL2L11	O43521	198 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	LY6G6C	O95867	125 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	BTN1A1	Q13410	526 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	ZNF726P1	Q15940	193 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	CBY3	A6NI87	242 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	UMAD1	C9J7I0	102 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241		K7EQM0	130 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	SSX7	Q7RTT5	188 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241		Q8TAT8	98 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	SNURFL	B1AK76	121 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241		Q6AWC8	147 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKDCC-204	ENST00000475241	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		11.96	□□□□□ -0.49

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