RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-216ENST00000475195 KLLNB2CW77 178 aa11.74□□□□□ -0.53
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ATG4B-216ENST00000475195 CRISP2P16562 243 aa11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-216ENST00000475195 EMP1P54849 157 aa11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-216ENST00000475195 FAM222AQ5U5X8 452 aa11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-216ENST00000475195 FAM122CQ6P4D5 195 aa11.74□□□□□ -0.53
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ATG4B-216ENST00000475195 OTORQ9NRC9 128 aa11.72□□□□□ -0.53
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ATG4B-216ENST00000475195 TMEM78Q5T7P6 136 aa11.71□□□□□ -0.53
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ATG4B-216ENST00000475195 C16orf74Q96GX8 76 aa11.71□□□□□ -0.53
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ATG4B-216ENST00000475195 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
ATG4B-216ENST00000475195 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa11.71□□□□□ -0.53
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ATG4B-216ENST00000475195 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa11.67□□□□□ -0.54
ATG4B-216ENST00000475195 CCDC28AQ8IWP9 274 aa11.67□□□□□ -0.54
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ATG4B-216ENST00000475195 CBY3A6NI87 242 aa11.65□□□□□ -0.54
ATG4B-216ENST00000475195 SEC11BP0C7V7 166 aa11.65□□□□□ -0.54
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ATG4B-216ENST00000475195 Q6ZQT7 251 aa11.64□□□□□ -0.55
ATG4B-216ENST00000475195 TCTE3Q8IZS6 198 aa11.64□□□□□ -0.55
ATG4B-216ENST00000475195 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
ATG4B-216ENST00000475195 C11orf72Q8NBR9 251 aa11.64□□□□□ -0.55
ATG4B-216ENST00000475195 KMT2AQ03164 3969 aa11.63□□□□□ -0.55
ATG4B-216ENST00000475195 DEFB130BP0DP73 79 aa11.63□□□□□ -0.55
ATG4B-216ENST00000475195 DEFB130AP0DP74 79 aa11.63□□□□□ -0.55
ATG4B-216ENST00000475195 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ATG4B-216ENST00000475195 Q6AWC8 147 aa11.63□□□□□ -0.55
ATG4B-216ENST00000475195 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa11.63□□□□□ -0.55
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