RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 Q5VSD8 79 aa7.63□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 TRIQKQ629K1 86 aa7.63□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.63□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 VGLL1Q99990 258 aa7.63□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.62□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 IGSF23A1L1A6 192 aa7.62□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 KLLNB2CW77 178 aa7.62□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 SPINK4O60575 86 aa7.62□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 PRAF2O60831 178 aa7.62□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 SPANXN2Q5MJ10 180 aa7.62□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 Q8TAT8 98 aa7.62□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 MITD1Q8WV92 249 aa7.62□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.62□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 ODF3Q96PU9 254 aa7.62□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 SEC22CQ9BRL7 303 aa7.62□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 GGACTQ9BVM4 153 aa7.62□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.62□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7.62□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.62□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.62□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 A0A087WTM6 91 aa7.61□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 E5RGE8 158 aa7.61□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 SFTA3P0C7M3 94 aa7.61□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 ERVFC1-1P60608 527 aa7.61□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 BAXQ07812 192 aa7.61□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 FHL2Q14192 279 aa7.61□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 FAM122CQ6P4D5 195 aa7.61□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.61□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 Q6ZRG5 221 aa7.61□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.61□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.61□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 DEDD2Q8WXF8 326 aa7.61□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 UQCC1Q9NVA1 299 aa7.61□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.61□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 RNF24Q9Y225 148 aa7.61□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 TRAV6A0A075B6T7 132 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 NAP1L6A6NFF2 107 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 GPX1P07203 203 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 FGF7P21781 194 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 CRYBA4P53673 196 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 TCL1AP56279 114 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 S100A10P60903 97 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 ICAM4Q14773 271 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 GUK1Q16774 197 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 MUC21Q5SSG8 566 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 ZNF680Q8NEM1 530 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 OR1L4Q8NGR5 311 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 ST6GAL2Q96JF0 529 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 TIMM9Q9Y5J7 89 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 C5orf51A6NDU8 294 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 RGS13O14921 159 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 PLA2G10O15496 165 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 MPDU1O75352 247 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 IL7P13232 177 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 RAB31Q13636 194 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 ZNF846Q147U1 533 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 MIR17HGQ75NE6 70 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 ZNF479Q96JC4 524 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 C20orf85Q9H1P6 137 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-209ENST00000473257 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 EREGO14944 169 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.58□□□□□ -1.26e-9■■■□□ 16.1
ACTB-209ENST00000473257 OR10J4P0C629 311 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 CRISP2P16562 243 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 RPL29P47914 159 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 VWC2Q2TAL6 325 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 THAP6Q8TBB0 222 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 LINC00477Q96M19 166 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 C18orf15Q96N68 181 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 PFDN5Q99471 154 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 TMEM14CQ9P0S9 112 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 PRO0255Q9UI72 69 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 K7EQD1 137 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 ZNF253O75346 499 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 RAB32Q13637 225 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 TMEM252Q8N6L7 170 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 FRZBQ92765 325 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 ARPC5LQ9BPX5 153 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 CENPXA8MT69 81 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 IFNA5P01569 189 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 GYPEP15421 78 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 SULT1A1P50225 295 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 ZNF415Q09FC8 603 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-209ENST00000473257 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
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