RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 ATP6V0CP27449 155 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF90Q03938 601 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 Q8N6K4 173 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 IL17DQ8TAD2 202 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 MDFIQ99750 246 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 TRAV25A0A0B4J276 109 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 PDE6DO43924 150 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 BRI3O95415 125 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 IGKV1-39P01597 117 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 IGKV1D-39P04432 117 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 CCL20P78556 96 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 IL15RAQ13261 267 aa7.18□□□□□ -1.26
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DDX39B-215ENST00000462256 XCL2Q9UBD3 114 aa7.17□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 IGSF23A1L1A6 192 aa7.17□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 PSMB8P28062 276 aa7.17□□□□□ -1.26
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DDX39B-215ENST00000462256 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa7.17□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 TVP23CQ96ET8 276 aa7.17□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 HIVEP1P15822 2718 aa7.17□□□□□ -1.26
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DDX39B-215ENST00000462256 TMEM37Q8WXS4 190 aa7.17□□□□□ -1.26
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DDX39B-215ENST00000462256 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 SH3BGRL3Q9H299 93 aa7.17□□□□□ -1.26
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DDX39B-215ENST00000462256 DPPA3Q6W0C5 159 aa7.16□□□□□ -1.26
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DDX39B-215ENST00000462256 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 FUT9Q9Y231 359 aa7.16□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 TEX22C9J3V5 150 aa7.16□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.16□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 OR4D5Q8NGN0 318 aa7.16□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 RCHY1Q96PM5 261 aa7.16□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 SMDT1Q9H4I9 107 aa7.16□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.16□□□□□ -1.26
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DDX39B-215ENST00000462256 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa7.16□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 LEPP41159 167 aa7.16□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.16□□□□□ -1.26
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DDX39B-215ENST00000462256 ISLRO14498 428 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.15□□□□□ -1.26
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DDX39B-215ENST00000462256 K7EMT4 169 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 INSP01308 110 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 TRBV12-3P01733 135 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX39B-215ENST00000462256 FXYD7P58549 80 aa7.15□□□□□ -1.26
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DDX39B-215ENST00000462256 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.15□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 OR2K2Q8NGT1 345 aa7.15□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 COX11Q9Y6N1 276 aa7.15□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 IGLC1P0CG04 106 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 AZU1P20160 251 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM241Q24JQ0 296 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 FANCD2OSQ96PS1 177 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 SPXQ9BT56 116 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 GGTLC1Q9BX51 225 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 CTSGP08311 255 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 KNCNA6PVL3 124 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 PLP1P60201 277 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 SYT8Q8NBV8 401 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 SPATA25Q9BR10 227 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 NUPR1O60356 82 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 BAGE2Q86Y30 109 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 RELNP78509 3460 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 B5MCH6 92 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 PPIFP30405 207 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 GNG4P50150 75 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 VAMP8Q9BV40 100 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 PAGE4O60829 102 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM183BQ1AE95 376 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 I3L2K1 104 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 TNFRSF6BO95407 300 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 ARL14EPLP0DKL9 152 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 Q6ZN92 141 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 Q6ZPA2 131 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-215ENST00000462256 MIR17HGQ75NE6 70 aa7.12□□□□□ -1.27
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