RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460176.6

GARNL3-211, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 5

Gene GARNL3, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-211ENST00000460176 CSN1S1P47710 185 aa7.51□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 ERCC8Q13216 396 aa7.51□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 CST9LP1Q5W188 147 aa7.51□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.51□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.51□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 KIR2DL5AQ8N109 375 aa7.51□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa7.51□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 VGLL1Q99990 258 aa7.51□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 RPH3ALQ9UNE2 315 aa7.51□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 FBN3Q75N90 2809 aa7.51□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 RBAKDNA6NC62 111 aa7.5□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 CT45A10P0DMU9 189 aa7.5□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 BCL2P10415 239 aa7.5□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 APOC4P55056 127 aa7.5□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 HAGHQ16775 308 aa7.5□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF767PQ75MW2 155 aa7.5□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.5□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 TCEAL7Q9BRU2 100 aa7.5□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 ATG101Q9BSB4 218 aa7.5□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.5□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 CSTL1Q9H114 145 aa7.5□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 SLC35B3Q9H1N7 401 aa7.5□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa7.49□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa7.49□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 C11orf94C9JXX5 98 aa7.49□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 PEX7O00628 323 aa7.49□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 CA1P00915 261 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 IFNA1P01562 189 aa7.49□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 FXYD7P58549 80 aa7.49□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.49□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 LINC00477Q96M19 166 aa7.49□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 ODF3Q96PU9 254 aa7.49□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 B9D2Q9BPU9 175 aa7.49□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 VAX2Q9UIW0 290 aa7.49□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa7.48□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 M0R2Z0 102 aa7.48□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 UBE2CO00762 179 aa7.48□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 IGLV2-11P01706 119 aa7.48□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF138P52744 262 aa7.48□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.48□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.48□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa7.48□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM75Q8N9X5 138 aa7.48□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 Q8TAT8 98 aa7.48□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 HIST1H2BAQ96A08 127 aa7.48□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 C11orf52Q96A22 123 aa7.48□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 LINC00479Q96M42 142 aa7.48□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 ASCL2Q99929 193 aa7.48□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 TXNDC17Q9BRA2 123 aa7.48□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF492Q9P255 531 aa7.48□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 TRAV34A0A0B4J273 112 aa7.47□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.47□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 RBFOX3A6NFN3 312 aa7.47□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 CRXO43186 299 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 AMBPP02760 352 aa7.47□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 CRISP2P16562 243 aa7.47□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF506Q5JVG8 444 aa7.47□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 CLLU1Q5K131 121 aa7.47□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.47□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.47□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 TVP23CQ96ET8 276 aa7.47□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 SGK494Q96LW2 274 aa7.47□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 FAM210AQ96ND0 272 aa7.47□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 RARRES2Q99969 163 aa7.47□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.47□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa7.47□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 XCL2Q9UBD3 114 aa7.47□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 PSG8Q9UQ74 426 aa7.47□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 KLF12Q9Y4X4 402 aa7.47□□□□□ -1.21
GARNL3-211ENST00000460176 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7.46□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.46□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 F6UZH7 168 aa7.46□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 K7EQM0 130 aa7.46□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 LEPP41159 167 aa7.46□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 CDKN1BP46527 198 aa7.46□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 RAB14P61106 215 aa7.46□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 KIR3DS1Q14943 382 aa7.46□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 DEFB135Q30KP9 77 aa7.46□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 TOR2AQ5JU69 321 aa7.46□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 PRR9Q5T870 116 aa7.46□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 Q6ZWC4 215 aa7.46□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.46□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.46□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 RETNQ9HD89 108 aa7.46□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa7.45□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 KLLNB2CW77 178 aa7.45□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 PDE6DO43924 150 aa7.45□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.45□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 TSPOP30536 169 aa7.45□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 AKR1C3P42330 323 aa7.45□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM183BQ1AE95 376 aa7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.2 ms