RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 DPF1Q92782 380 aa7.02□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.02□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 NRN1Q9NPD7 142 aa7.02□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 TLN2Q9Y4G6 2542 aa7.02□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 H3BTX0 84 aa7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 SOCS3O14543 225 aa7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 MGST1P10620 155 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR4B1Q8NGF8 309 aa7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.01□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRAV34A0A0B4J273 112 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 C19orf71A6NCJ1 209 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 IZUMO1RA6ND01 250 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 C2orf70A6NJV1 201 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 NPIPB6E9PJ23 425 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 M0QZ24 198 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 ID1P41134 155 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 NDUFA6P56556 154 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 SYNJ2BPP57105 145 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 GNG5P63218 68 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q86TA4 180 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 NUDT10Q8NFP7 164 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR9G4Q8NGQ1 327 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 TSKUQ8WUA8 353 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 NUDT11Q96G61 164 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 PSG8Q9UQ74 426 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 SONP18583 2426 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 A8MWL6 223 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 M0R3E3 92 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 OVOL1O14753 267 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 CD28P10747 220 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 DNLZQ5SXM8 178 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 TCF24Q7RTU0 167 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 DCANP1Q8TF63 244 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 C16orf92Q96LL3 132 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC00477Q96M19 166 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 HIVEP1P15822 2718 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 CUBNO60494 3623 aa6.99□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 CCL24O00175 119 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 HLA-DQA1P01909 254 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 PAFAH1B2P68402 229 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRR25Q96S07 402 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC00587B1AMM8 73 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 P01737 135 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 CSN3P07498 182 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 S100A2P29034 98 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 TNP2Q05952 138 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRNTQ86SH4 94 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 RAX2Q96IS3 184 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 NIT2Q9NQR4 276 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 XKRY2A2RUG3 117 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-202ENST00000444658 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-202ENST00000444658 SNURFLB1AK76 121 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-202ENST00000444658 K7EQG2 157 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF138P52744 262 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLURP1P55000 103 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q0VG73 95 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-202ENST00000444658 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.1 ms