RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431645.1

SRRT-202, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 397 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-202ENST00000431645 OR10J3Q5JRS4 329 aa7.42□□□□□ -1.22
SRRT-202ENST00000431645 PXDC1Q5TGL8 231 aa7.42□□□□□ -1.22
SRRT-202ENST00000431645 BLNKQ8WV28 456 aa7.42□□□□□ -1.22
SRRT-202ENST00000431645 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa7.42□□□□□ -1.22
SRRT-202ENST00000431645 V9GYH0 126 aa7.42□□□□□ -1.22
SRRT-202ENST00000431645 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.41□□□□□ -1.22
SRRT-202ENST00000431645 PRSS46E5RG02 174 aa7.41□□□□□ -1.22
SRRT-202ENST00000431645 LECT2O14960 151 aa7.41□□□□□ -1.22
SRRT-202ENST00000431645 SFTA3P0C7M3 94 aa7.41□□□□□ -1.22
SRRT-202ENST00000431645 VAMP1P23763 118 aa7.41□□□□□ -1.22
SRRT-202ENST00000431645 ASAH1Q13510 395 aa7.41□□□□□ -1.22
SRRT-202ENST00000431645 CNPY1Q3B7I2 92 aa7.41□□□□□ -1.22
SRRT-202ENST00000431645 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.41□□□□□ -1.22
SRRT-202ENST00000431645 ZNF546Q86UE3 836 aa7.41□□□□□ -1.22
SRRT-202ENST00000431645 TMEM37Q8WXS4 190 aa7.41□□□□□ -1.22
SRRT-202ENST00000431645 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa7.4□□□□□ -1.22
SRRT-202ENST00000431645 RBFOX3A6NFN3 312 aa7.4□□□□□ -1.22
SRRT-202ENST00000431645 PITX3O75364 302 aa7.4□□□□□ -1.22
SRRT-202ENST00000431645 IGHV3-30P01768 117 aa7.4□□□□□ -1.22
SRRT-202ENST00000431645 IGHV3-33P01772 117 aa7.4□□□□□ -1.22
SRRT-202ENST00000431645 OR4E1P0C645 316 aa7.4□□□□□ -1.22
SRRT-202ENST00000431645 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.4□□□□□ -1.22
SRRT-202ENST00000431645 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.4□□□□□ -1.22
SRRT-202ENST00000431645 SLC38A11Q08AI6 406 aa7.4□□□□□ -1.22
SRRT-202ENST00000431645 IL18Q14116 193 aa7.4□□□□□ -1.22
SRRT-202ENST00000431645 GUK1Q16774 197 aa7.4□□□□□ -1.22
SRRT-202ENST00000431645 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.4□□□□□ -1.22
SRRT-202ENST00000431645 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.4□□□□□ -1.22
SRRT-202ENST00000431645 NDUFA13Q9P0J0 144 aa7.4□□□□□ -1.22
SRRT-202ENST00000431645 FABP12A6NFH5 140 aa7.39□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 IGLV2-8P01709 118 aa7.39□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 SLC25A6P12236 298 aa7.39□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 CD300CQ08708 224 aa7.39□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 ERCC8Q13216 396 aa7.39□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 LINC01620Q4KN68 170 aa7.39□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.39□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 MORN5Q5VZ52 161 aa7.39□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.39□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 PATE2Q6UY27 113 aa7.39□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 OR10P1Q8NGE3 313 aa7.39□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 SMIM4Q8WVI0 70 aa7.39□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 ZNF479Q96JC4 524 aa7.39□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 LINC00477Q96M19 166 aa7.39□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 SRRQ9GZT4 340 aa7.39□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 PSENENQ9NZ42 101 aa7.39□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa7.39□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 KLLNB2CW77 178 aa7.38□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 AGPAT2O15120 278 aa7.38□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 OPCMLQ14982 345 aa7.38□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 TRIM63Q969Q1 353 aa7.38□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 RABL2BQ9UNT1 228 aa7.38□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 CTDSPLO15194 276 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 SSSCA1O60232 199 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 HOXB5P09067 269 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 IGLC2P0DOY2 106 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 LAGE3Q14657 143 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 ZNF846Q147U1 533 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 Q6ZRG5 221 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 IQCF2Q8IXL9 164 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 OR10G4Q8NGN3 311 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 TIMM9Q9Y5J7 89 aa7.37□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.36□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 H3BQ15 152 aa7.36□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 K7EPK0 472 aa7.36□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 PFN1P07737 140 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 TIRAPP58753 221 aa7.36□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 WFDC2Q14508 124 aa7.36□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 BAK1Q16611 211 aa7.36□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 TMEM128Q5BJH2 165 aa7.36□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 TOR2AQ5JU69 321 aa7.36□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.36□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 PRELID1Q9Y255 219 aa7.36□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 M0R3E3 92 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 NMBP08949 121 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 METTL15P1P0C7V9 234 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 S100A5P33763 92 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 FAUP35544 74 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 RAB31Q13636 194 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 PYDC2Q56P42 97 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 MUC21Q5SSG8 566 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 OR1L4Q8NGR5 311 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 RMI2Q96E14 147 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 SPXQ9BT56 116 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 COX11Q9Y6N1 276 aa7.35□□□□□ -1.23
SRRT-202ENST00000431645 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms