RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.62□□□□□ -1.19
ATG4B-210ENST00000428861 SSX7Q7RTT5 188 aa7.62□□□□□ -1.19
ATG4B-210ENST00000428861 OR10G4Q8NGN3 311 aa7.62□□□□□ -1.19
ATG4B-210ENST00000428861 OR10G9Q8NGN4 311 aa7.62□□□□□ -1.19
ATG4B-210ENST00000428861 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.62□□□□□ -1.19
ATG4B-210ENST00000428861 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.62□□□□□ -1.19
ATG4B-210ENST00000428861 KLLNB2CW77 178 aa7.61□□□□□ -1.19
ATG4B-210ENST00000428861 H7BYZ3 331 aa7.61□□□□□ -1.19
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ATG4B-210ENST00000428861 BTN1A1Q13410 526 aa7.61□□□□□ -1.19
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ATG4B-210ENST00000428861 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.61□□□□□ -1.19
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ATG4B-210ENST00000428861 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
ATG4B-210ENST00000428861 OR11H4Q8NGC9 324 aa7.61□□□□□ -1.19
ATG4B-210ENST00000428861 Q8TAT8 98 aa7.61□□□□□ -1.19
ATG4B-210ENST00000428861 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00477Q96M19 166 aa7.61□□□□□ -1.19
ATG4B-210ENST00000428861 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
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ATG4B-210ENST00000428861 A0A1W2PPV4 95 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-210ENST00000428861 ARPC5O15511 151 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-210ENST00000428861 STAG3L2P0CL84 134 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-210ENST00000428861 STAG3L3P0CL85 134 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-210ENST00000428861 ARL14EPLP0DKL9 152 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-210ENST00000428861 CRISP2P16562 243 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-210ENST00000428861 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-210ENST00000428861 TAS2R45P59539 299 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-210ENST00000428861 RAB24Q969Q5 203 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-210ENST00000428861 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF492Q9P255 531 aa7.6□□□□□ -1.19
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ATG4B-210ENST00000428861 C7orf71A4D174 169 aa7.59□□□□□ -1.19
ATG4B-210ENST00000428861 PGPA6NDG6 321 aa7.59□□□□□ -1.19
ATG4B-210ENST00000428861 LYRM9A8MSI8 78 aa7.59□□□□□ -1.19
ATG4B-210ENST00000428861 DIRC3C9JPN6 131 aa7.59□□□□□ -1.19
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ATG4B-210ENST00000428861 DEFB130AP0DP74 79 aa7.59□□□□□ -1.19
ATG4B-210ENST00000428861 HTN3P15516 51 aa7.59□□□□□ -1.19
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ATG4B-210ENST00000428861 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.57□□□□□ -1.2
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ATG4B-210ENST00000428861 RPH3ALQ9UNE2 315 aa7.57□□□□□ -1.2
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ATG4B-210ENST00000428861 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa7.56□□□□□ -1.2
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ATG4B-210ENST00000428861 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.56□□□□□ -1.2
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ATG4B-210ENST00000428861 NDUFAF3Q9BU61 184 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.55□□□□□ -1.2
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ATG4B-210ENST00000428861 TAAR5O14804 337 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 ST6GAL2Q96JF0 529 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 KLF12Q9Y4X4 402 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 GAGE12BA1L429 117 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 CBY3A6NI87 242 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 HMSDA8MTL9 139 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 F5H768 121 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 GAGE7O76087 117 aa7.54□□□□□ -1.2
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