RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PYGO2Q9BRQ0 406 aa11.89□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 K7EM74 188 aa11.89□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CDKN1BP46527 198 aa11.89□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa11.89□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 G3V318 75 aa11.89□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM243Q9BU79 118 aa11.89□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGLL1P15814 213 aa11.88□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WT1-ASQ06250 92 aa11.88□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SIVA1O15304 175 aa11.88□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LTAP01374 205 aa11.88□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ARTNQ5T4W7 220 aa11.88□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NPYP01303 97 aa11.88□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa11.88□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SMIM2Q9BVW6 85 aa11.88□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A1W2PPM0 123 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGLV1-44P01699 117 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BOD1L2Q8IYS8 172 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C20orf78Q9BR46 151 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RP1P56715 2156 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF134P52741 427 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DAD1P61803 113 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TPSG1Q9NRR2 321 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FGF6P10767 208 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CFHR3Q02985 330 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NDUFA12Q9UI09 145 aa11.87□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGLV3-1P01715 115 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 U3KQA8 63 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VOPP1Q96AW1 172 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 F8VRH5 84 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PFN2P35080 140 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRO1854Q9UHT4 67 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 APOC4P55056 127 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RPL32P62910 135 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNRF2Q8NHG8 242 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 H3BUA1 57 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 K7EP13 123 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGLC1P0CG04 106 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NKAPP1Q8N9T2 125 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WISP1O95388 367 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UBL5Q9BZL1 73 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HERVK_113P63121 156 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VWA8A3KMH1 1905 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 F5H768 121 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TPRP12270 2363 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 COL4A6Q14031 1691 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PLA2G2CQ5R387 149 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 Q96MF0 132 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C8orf31Q8N9H6 132 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 K7EN84 100 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NPSP0C0P6 89 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRR20EP86478 221 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRR20CP86479 221 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRR20DP86480 221 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRR20BP86481 221 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRR20AP86496 221 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 POU2AF1Q16633 256 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa11.83□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa11.83□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MORN5Q5VZ52 161 aa11.83□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa11.83□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GAGE6Q13070 117 aa11.83□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NDUFS7O75251 213 aa11.83□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GAGE7O76087 117 aa11.83□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GAGE12FP0CL80 117 aa11.83□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GAGE12GP0CL81 117 aa11.83□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GAGE12IP0CL82 117 aa11.83□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IFITM1P13164 125 aa11.83□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HLA-DMBP28068 263 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VWC2Q2TAL6 325 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 J3QQQ9 107 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF524Q96C55 264 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KAAG1Q9UBP8 84 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TSC2P49815 1807 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ELANEP08246 267 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LYPD6BQ8NI32 183 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RMI2Q96E14 147 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CARD19Q96LW7 228 aa11.82□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RBAKDNA6NC62 111 aa11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM126AQ9H061 195 aa11.81□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CRLF1O75462 422 aa11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 140.5 ms