RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DEFB4AO15263 64 aa6.15□□□□□ -1.42
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR10J4P0C629 311 aa6.15□□□□□ -1.42
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STAG3L2P0CL84 134 aa6.15□□□□□ -1.42
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STAG3L3P0CL85 134 aa6.15□□□□□ -1.42
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CRISP2P16562 243 aa6.15□□□□□ -1.42
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATP6V0CP27449 155 aa6.15□□□□□ -1.42
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ICAM4Q14773 271 aa6.15□□□□□ -1.42
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.15□□□□□ -1.42
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BAP18Q8IXM2 172 aa6.15□□□□□ -1.42
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.15□□□□□ -1.42
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.15□□□□□ -1.42
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.15□□□□□ -1.42
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.15□□□□□ -1.42
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 Q9H3A6 140 aa6.15□□□□□ -1.42
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OTORQ9NRC9 128 aa6.15□□□□□ -1.42
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A0D9SG52 128 aa6.14□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KLLNB2CW77 178 aa6.14□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRAC2D3DTV9 90 aa6.14□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RAB2AP61019 212 aa6.14□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C12orf74Q32Q52 190 aa6.14□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.14□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.14□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.14□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.14□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 Q6ZTC4 211 aa6.14□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.14□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SUN5Q8TC36 379 aa6.14□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF503Q96F45 646 aa6.14□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.14□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LINC01587Q99440 93 aa6.14□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.13□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.13□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.13□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C7orf71A4D174 169 aa6.13□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 G3V3Q6 166 aa6.13□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 K7EQM0 130 aa6.13□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARPC5O15511 151 aa6.13□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CXorf1O96002 111 aa6.13□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CT45A10P0DMU9 189 aa6.13□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF138P52744 262 aa6.13□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DAD1P61803 113 aa6.13□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RANP62826 216 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 Q5BKY6 102 aa6.13□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.13□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.13□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.13□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.13□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.13□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.13□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF492Q9P255 531 aa6.13□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CELA1Q9UNI1 258 aa6.13□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SNURFLB1AK76 121 aa6.12□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UMAD1C9J7I0 102 aa6.12□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GPX1P07203 203 aa6.12□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.12□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.12□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RAB24Q969Q5 203 aa6.12□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.12□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.12□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.12□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.12□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.11□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.11□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A1W2PRE2 83 aa6.11□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PGPA6NDG6 321 aa6.11□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGLL5B9A064 214 aa6.11□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DIRC3C9JPN6 131 aa6.11□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SEC11BP0C7V7 166 aa6.11□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GCHFRP30047 84 aa6.11□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EMP1P54849 157 aa6.11□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.11□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.11□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.11□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STOML3Q8TAV4 291 aa6.11□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.11□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.1□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.1□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CBY3A6NI87 242 aa6.1□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BCL2L11O43521 198 aa6.1□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATP5G1P05496 136 aa6.1□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 P0DMU3 169 aa6.1□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM231AP0DMU4 169 aa6.1□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM231CP0DMU5 169 aa6.1□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATP5G3P48201 142 aa6.1□□□□□ -1.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ERCC8Q13216 396 aa6.1□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms