RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 FAM231BA6NCW3 169 aa7.42□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 M0R3E3 92 aa7.42□□□□□ -1.22
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POLR1A-202ENST00000409024 RAB5AP20339 215 aa7.42□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 FHL3Q13643 280 aa7.42□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 COX19Q49B96 90 aa7.42□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.42□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 TCF24Q7RTU0 167 aa7.42□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 PRNTQ86SH4 94 aa7.42□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 C3orf56Q8N813 242 aa7.42□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
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POLR1A-202ENST00000409024 V9GYV3 84 aa7.42□□□□□ -1.22
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POLR1A-202ENST00000409024 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa7.41□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.41□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 TYMSP04818 313 aa7.41□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 CT45A10P0DMU9 189 aa7.41□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 CD28P10747 220 aa7.41□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 OR5I1Q13606 314 aa7.41□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa7.41□□□□□ -1.22
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POLR1A-202ENST00000409024 NUDT11Q96G61 164 aa7.41□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 FAM210BQ96KR6 192 aa7.41□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 PRR25Q96S07 402 aa7.41□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.41□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV25A0A0B4J276 109 aa7.4□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.4□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 A8MWL6 223 aa7.4□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 CCL24O00175 119 aa7.4□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 P01737 135 aa7.4□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF138P52744 262 aa7.4□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.4□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 NDUFA11Q86Y39 141 aa7.4□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 GBGT1Q8N5D6 347 aa7.4□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 OR10J6PQ8NGY7 276 aa7.4□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 DCANP1Q8TF63 244 aa7.4□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 SRD5A3Q9H8P0 318 aa7.4□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa7.4□□□□□ -1.22
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa7.39□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 XKRY2A2RUG3 117 aa7.39□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.39□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 K7EQG2 157 aa7.39□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 SLURP1P55000 103 aa7.39□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 SMUG1Q53HV7 270 aa7.39□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 RASL11AQ6T310 242 aa7.39□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF738Q8NE65 137 aa7.39□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 TSKUQ8WUA8 353 aa7.39□□□□□ -1.23
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POLR1A-202ENST00000409024 RAX2Q96IS3 184 aa7.39□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 ASCL2Q99929 193 aa7.39□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.38□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 FABP5P3A8MUU1 101 aa7.38□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 CSN3P07498 182 aa7.38□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 CXCL1P09341 107 aa7.38□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 HLA-DMBP28068 263 aa7.38□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 RAB5BP61020 215 aa7.38□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 PRR31Q5SQ13 230 aa7.38□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 FAM162BQ5T6X4 162 aa7.38□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 Q6AWC8 147 aa7.38□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.38□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 RNF182Q8N6D2 247 aa7.38□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 NHLRC2Q8NBF2 726 aa7.38□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 OR2K2Q8NGT1 345 aa7.38□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 SGK494Q96LW2 274 aa7.38□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 ODF3Q96PU9 254 aa7.38□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 VGLL1Q99990 258 aa7.38□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.38□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.38□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.38□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1W2PPQ1 181 aa7.37□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 IZUMO1RA6ND01 250 aa7.37□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 PRAC2D3DTV9 90 aa7.37□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 RPS10P46783 165 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 DEFB136Q30KP8 78 aa7.37□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.37□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 PRR27Q6MZM9 219 aa7.37□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 WDR73Q6P4I2 378 aa7.37□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.37□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 OR8A1Q8NGG7 326 aa7.37□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 DYNLRB2Q8TF09 96 aa7.37□□□□□ -1.23
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