RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 C7orf71A4D174 169 aa6.05□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 KLLNB2CW77 178 aa6.05□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 TAAR5O14804 337 aa6.05□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 ATP5G1P05496 136 aa6.05□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 GPX1P07203 203 aa6.05□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 OR10J4P0C629 311 aa6.05□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 ATP5G3P48201 142 aa6.05□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF138P52744 262 aa6.05□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 RANP62826 216 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.05□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.05□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.05□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.05□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.05□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.05□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.05□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.05□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 TMED6Q8WW62 240 aa6.05□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.05□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 OTORQ9NRC9 128 aa6.05□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF492Q9P255 531 aa6.05□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.05□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.04□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 SNURFLB1AK76 121 aa6.04□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 HTN1P15515 57 aa6.04□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 AZU1P20160 251 aa6.04□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.04□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.04□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.04□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.04□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.04□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.04□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 Q9H3A6 140 aa6.04□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.03□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.03□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.03□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 DEFB130BP0DP73 79 aa6.03□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 DEFB130AP0DP74 79 aa6.03□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 ATP6V0CP27449 155 aa6.03□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 RAB2AP61019 212 aa6.03□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 ERCC8Q13216 396 aa6.03□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 RNF212Q495C1 297 aa6.03□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.03□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF503Q96F45 646 aa6.03□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.03□□□□□ -1.44
MT-TS1-201ENST00000387416 PGPA6NDG6 321 aa6.02□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 DIRC3C9JPN6 131 aa6.02□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 K7EQM0 130 aa6.02□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 RGS13O14921 159 aa6.02□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 STAG3L2P0CL84 134 aa6.02□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 STAG3L3P0CL85 134 aa6.02□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 HTN3P15516 51 aa6.02□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 KIR3DS1Q14943 382 aa6.02□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 Q5BKY6 102 aa6.02□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.02□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.02□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 SUN5Q8TC36 379 aa6.02□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 RAB24Q969Q5 203 aa6.02□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.02□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 VGLL1Q99990 258 aa6.02□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.02□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.01□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 RNF222A6NCQ9 220 aa6.01□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 F5H768 121 aa6.01□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 J3KRW8 73 aa6.01□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 CXorf1O96002 111 aa6.01□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 PRM2P04554 102 aa6.01□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 CD300CQ08708 224 aa6.01□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.01□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 HYLS1Q96M11 299 aa6.01□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 C18orf15Q96N68 181 aa6.01□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 MUC4Q99102 2169 aa6.01□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 HMSDA8MTL9 139 aa6□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 H3BNG1 76 aa6□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 GCHFRP30047 84 aa6□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF345Q14585 488 aa6□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 Q6AWC8 147 aa6□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM88Q6PEY1 159 aa6□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6□□□□□ -1.45
MT-TS1-201ENST00000387416 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6□□□□□ -1.45
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