RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 RBMY1CP0DJD4 496 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 ERCC8Q13216 396 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 DPPA3Q6W0C5 159 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa11.11□□□□□ -0.63
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PGGT1B-202ENST00000379615 DIRC3C9JPN6 131 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
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PGGT1B-202ENST00000379615 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 ZFP69Q49AA0 526 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 CASC10Q5T4H9 136 aa11.11□□□□□ -0.63
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PGGT1B-202ENST00000379615 LINC01587Q99440 93 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa11.1□□□□□ -0.63
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF492Q9P255 531 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa11.09□□□□□ -0.63
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PGGT1B-202ENST00000379615 FAM213BQ8TBF2 198 aa11.08□□□□□ -0.64
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PGGT1B-202ENST00000379615 C7orf71A4D174 169 aa11.07□□□□□ -0.64
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PGGT1B-202ENST00000379615 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF493Q6ZR52 646 aa11.07□□□□□ -0.64
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PGGT1B-202ENST00000379615 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
PGGT1B-202ENST00000379615 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa11.06□□□□□ -0.64
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PGGT1B-202ENST00000379615 HTN1P15515 57 aa11.06□□□□□ -0.64
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PGGT1B-202ENST00000379615 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
PGGT1B-202ENST00000379615 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
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PGGT1B-202ENST00000379615 EPDR1Q9UM22 224 aa11.06□□□□□ -0.64
PGGT1B-202ENST00000379615 C11orf94C9JXX5 98 aa11.05□□□□□ -0.64
PGGT1B-202ENST00000379615 TEX46H3BTG2 121 aa11.05□□□□□ -0.64
PGGT1B-202ENST00000379615 TCRAP04437 139 aa11.05□□□□□ -0.64
PGGT1B-202ENST00000379615 H2AFB1P0C5Y9 115 aa11.05□□□□□ -0.64
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PGGT1B-202ENST00000379615 PPT1P50897 306 aa11.05□□□□□ -0.64
PGGT1B-202ENST00000379615 KIR3DS1Q14943 382 aa11.05□□□□□ -0.64
PGGT1B-202ENST00000379615 C9orf62Q8N4C0 152 aa11.05□□□□□ -0.64
PGGT1B-202ENST00000379615 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa11.05□□□□□ -0.64
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PGGT1B-202ENST00000379615 C16orf74Q96GX8 76 aa11.05□□□□□ -0.64
PGGT1B-202ENST00000379615 NDFIP1Q9BT67 221 aa11.05□□□□□ -0.64
PGGT1B-202ENST00000379615 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa11.05□□□□□ -0.64
PGGT1B-202ENST00000379615 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PGGT1B-202ENST00000379615 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa11.05□□□□□ -0.64
PGGT1B-202ENST00000379615 TENM2Q9NT68 2774 aa11.05□□□□□ -0.64
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PGGT1B-202ENST00000379615 CD300CQ08708 224 aa11.04□□□□□ -0.64
PGGT1B-202ENST00000379615 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa11.04□□□□□ -0.64
PGGT1B-202ENST00000379615 TCEAL7Q9BRU2 100 aa11.04□□□□□ -0.64
PGGT1B-202ENST00000379615 ATG101Q9BSB4 218 aa11.04□□□□□ -0.64
PGGT1B-202ENST00000379615 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa11.04□□□□□ -0.64
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM74A7A6NL05 159 aa11.03□□□□□ -0.64
PGGT1B-202ENST00000379615 LYRM9A8MSI8 78 aa11.03□□□□□ -0.64
PGGT1B-202ENST00000379615 BTN1A1Q13410 526 aa11.03□□□□□ -0.64
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM222AQ5U5X8 452 aa11.03□□□□□ -0.64
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
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