RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373190.5

PTPRT-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,559 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-204ENST00000373190 SLC25A16P16260 332 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 MORN5Q5VZ52 161 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 USMG5Q96IX5 58 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 C8orf49Q96NF6 230 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 F8VRH5 84 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 FCN3O75636 299 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 RNF144BQ7Z419 303 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 FAM223BA6NKX1 122 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 INS-IGF2F8WCM5 200 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 INSP01308 110 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 MINOS1Q5TGZ0 78 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 FAM223AQ8IWN6 122 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF581Q9P0T4 197 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 ANAPC10Q9UM13 185 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 PRSS22Q9GZN4 317 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 CLPSP04118 112 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 NDPQ00604 133 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 OOSP1A8MZH6 123 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 TMEM178BH3BS89 294 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 IGKV1-16P04430 117 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 A0A1W2PRX2 142 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 GAGE5Q13069 117 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 GAGE6Q13070 117 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF726P1Q15940 193 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 DSCAMO60469 2012 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 C2CD3Q4AC94 2353 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 TMEM213A2RRL7 107 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 HLA-DRB4P13762 266 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 A0A1W2PPI3 338 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 C5orf24Q7Z6I8 188 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 C5orf63A6NC05 138 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 GAFA1Q96PS6 74 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 IL17RELQ6ZVW7 336 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 NDUFB8O95169 186 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 LINC00205P59089 165 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 HAPLN4Q86UW8 402 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 PINLYPA6NC86 204 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 LYPD6BQ8NI32 183 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF114Q8NC26 417 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 PAX9P55771 341 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 CARD19Q96LW7 228 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 METRNQ9UJH8 293 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 TECTAO75443 2155 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 I3L3M4 83 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 IGLC7A0M8Q6 106 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 B5MCH6 92 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 SS18Q15532 418 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 TMEM126AQ9H061 195 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 MYO9AB2RTY4 2548 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 DEFB125Q8N687 156 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 MUC4Q99102 2169 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 M0R1W7 72 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 CCL25O15444 150 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 TMEM219Q86XT9 240 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 ACACBO00763 2458 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 FHL1Q13642 323 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 AMTNQ6UX39 209 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 VWCEQ96DN2 955 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 TMEM258P61165 79 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 DSCR8Q96T75 97 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 CACNA1AO00555 2505 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-204ENST00000373190 MLANAQ16655 118 aa7.09□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 C12orf74Q32Q52 190 aa7.09□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 LINC00527Q9UJ94 153 aa7.09□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 CFHR1Q03591 330 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-204ENST00000373190 TMEM14CQ9P0S9 112 aa7.08□□□□□ -1.28
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