RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF492Q9P255 531 aa17.83■□□□□ 0.45
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM243Q9BU79 118 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 PTPRDP23468 1912 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 E9PQ18 207 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 H3BRN7 92 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF524Q96C55 264 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 PLA2G2CQ5R387 149 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 SUMO4Q6EEV6 95 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 FAM215AQ9Y5M1 114 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 J3QLI3 93 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF134P52741 427 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 FAM104BQ5XKR9 115 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM141Q96I45 108 aa17.81■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 TCF15Q12870 199 aa17.81■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 Q8N8P6 123 aa17.81■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 SDHAF1A6NFY7 115 aa17.81■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 VWC2Q2TAL6 325 aa17.81■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 HAPLN4Q86UW8 402 aa17.81■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 PRSS57Q6UWY2 283 aa17.81■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 IGKV1-39P01597 117 aa17.81■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 IGKV1D-39P04432 117 aa17.81■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 HLA-DRB4P13762 266 aa17.81■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 WT1-ASQ06250 92 aa17.81■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa17.81■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 GRNP28799 593 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 FANCMQ8IYD8 2048 aa17.8■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 NDUFS7O75251 213 aa17.8■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 PYY3Q5JQD4 70 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 PRSS33Q8NF86 280 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 A0A0J9YY99 117 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 TRAV25A0A0B4J276 109 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 C15orf65H3BRN8 121 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 C9JQL5 133 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 PRR25Q96S07 402 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 POLEQ07864 2286 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 DEFB112Q30KQ8 113 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 C18orf32Q8TCD1 76 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF726P1Q15940 193 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRM-201ENST00000332175 ANGP03950 147 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 DEFB136Q30KP8 78 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 IGHV4-59P01825 116 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 PRB1P04280 392 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF664Q8N3J9 261 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 IGLV1-44P01699 117 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 PRSS29PA6NIE9 313 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 GTSF1LQ9H1H1 148 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 WDR81Q562E7 1941 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 SPINK8P0C7L1 97 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 CEP250Q9BV73 2442 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 F6UB75 175 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 K7EM74 188 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 ATP6V0BQ99437 205 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 ZMAT4Q9H898 229 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 EREGO14944 169 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 IGLV2-23P01705 113 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 LINC00311Q8N616 119 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 HLA-DMBP28068 263 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 SCRT2Q9NQ03 307 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 C17orf77Q96MU5 243 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 SLAQ13239 276 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 DLEU1O43261 78 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 Q0VG73 95 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 MORN5Q5VZ52 161 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 SHISA9B4DS77 424 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 LHBP01229 141 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 MGAMO43451 1857 aa17.71■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa17.71■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 KIAA1671Q9BY89 1806 aa17.71■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 C22orf46C9J442 243 aa17.71■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 IGHV2-5P01817 119 aa17.71■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM14CQ9P0S9 112 aa17.71■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 COL6A6A6NMZ7 2263 aa17.71■□□□□ 0.43
PTPRM-201ENST00000332175 SOCS3O14543 225 aa17.71■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa17.7■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 Q6ZQT7 251 aa17.7■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 VOPP1Q96AW1 172 aa17.7■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 GNRH2O43555 120 aa17.7■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 V9GYV3 84 aa17.7■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa17.7■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa17.69■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 SPRNQ5BIV9 151 aa17.69■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 CT83Q5H943 113 aa17.69■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 PI4KAP42356 2102 aa17.69■□□□□ 0.42
PTPRM-201ENST00000332175 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms