RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 CLEC5AQ9NY25 188 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD8-201ENST00000313173 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD8-201ENST00000313173 PRAC2D3DTV9 90 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD8-201ENST00000313173 FAM106AQ4KMX7 169 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD8-201ENST00000313173 GPHB5Q86YW7 130 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD8-201ENST00000313173 MXRA5Q9NR99 2828 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD8-201ENST00000313173 CD5LO43866 347 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD8-201ENST00000313173 PDZD11Q5EBL8 140 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD8-201ENST00000313173 RNF152Q8N8N0 203 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD8-201ENST00000313173 K7EMT4 169 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD8-201ENST00000313173 RAB4BP61018 213 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD8-201ENST00000313173 Q8TAT8 98 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD8-201ENST00000313173 TM4SF20Q53R12 229 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXD8-201ENST00000313173 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
HOXD8-201ENST00000313173 C16orf92Q96LL3 132 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXD8-201ENST00000313173 A0A1B0GXF2 115 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXD8-201ENST00000313173 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
HOXD8-201ENST00000313173 OR10D4PQ8NGN7 298 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXD8-201ENST00000313173 NDFIP1Q9BT67 221 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXD8-201ENST00000313173 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXD8-201ENST00000313173 OTOGQ6ZRI0 2925 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD8-201ENST00000313173 ERCC8Q13216 396 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD8-201ENST00000313173 FAM162BQ5T6X4 162 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD8-201ENST00000313173 PGLYRP4Q96LB8 373 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD8-201ENST00000313173 SMPXQ9UHP9 88 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD8-201ENST00000313173 SH2D1AO60880 128 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD8-201ENST00000313173 UBE2E2Q96LR5 201 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD8-201ENST00000313173 UFC1Q9Y3C8 167 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXD8-201ENST00000313173 GZMBP10144 247 aa20.4■□□□□ 0.86
HOXD8-201ENST00000313173 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
HOXD8-201ENST00000313173 SOCS3O14543 225 aa20.39■□□□□ 0.86
HOXD8-201ENST00000313173 GDF5OSQ5U4N7 250 aa20.39■□□□□ 0.86
HOXD8-201ENST00000313173 YAE1D1Q9NRH1 226 aa20.39■□□□□ 0.86
HOXD8-201ENST00000313173 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 SONP18583 2426 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 CRISP2P16562 243 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 HBBP68871 147 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 LINC00469Q8N7U9 141 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 HIST1H2BLQ99880 126 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 NRN1Q9NPD7 142 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 APCSP02743 223 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 FABP4P15090 132 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 GRIFINA4D1Z8 144 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 BMI1P35226 326 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 CAMPP49913 170 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 C20orf173Q96LM9 149 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM189A5PLL7 270 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 SLAQ13239 276 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM78Q5T7P6 136 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 Q6AWC8 147 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 A0A1B0GUS0 222 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 AMBPP02760 352 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF138P52744 262 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 RPL11P62913 178 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 Q0VG73 95 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 KIAA1644Q3SXP7 199 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 REC114Q7Z4M0 266 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 KLHDC1Q8N7A1 406 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF738Q8NE65 137 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 SMR3AQ99954 134 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 A0A087WW49 117 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 EDN2P20800 178 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 DEFA6Q01524 100 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM213A2RRL7 107 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 A8MWP6 167 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM256Q8N2U0 113 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD8-201ENST00000313173 FAM181BA6NEQ2 426 aa20.33■□□□□ 0.84
HOXD8-201ENST00000313173 HAX1O00165 279 aa20.33■□□□□ 0.84
HOXD8-201ENST00000313173 LGALS9O00182 355 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXD8-201ENST00000313173 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HOXD8-201ENST00000313173 RPS20P60866 119 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HOXD8-201ENST00000313173 Q6ZSV7 163 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD8-201ENST00000313173 A0A1B0GUT8 65 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD8-201ENST00000313173 FABP5P3A8MUU1 101 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD8-201ENST00000313173 OVOL1O14753 267 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD8-201ENST00000313173 SRIP30626 198 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD8-201ENST00000313173 PKIAP61925 76 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD8-201ENST00000313173 OR10J3Q5JRS4 329 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD8-201ENST00000313173 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM18Q96B42 140 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD8-201ENST00000313173 ESM1Q9NQ30 184 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD8-201ENST00000313173 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
HOXD8-201ENST00000313173 SAMD13Q5VXD3 122 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD8-201ENST00000313173 CDPF1Q6NVV7 123 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD8-201ENST00000313173 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD8-201ENST00000313173 SYNJ2BPP57105 145 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD8-201ENST00000313173 RIGQ13278 110 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD8-201ENST00000313173 BAGE3Q86Y29 109 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD8-201ENST00000313173 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXD8-201ENST00000313173 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD8-201ENST00000313173 NUPR1O60356 82 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD8-201ENST00000313173 ARMS2P0C7Q2 107 aa20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms