RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 CFHR4Q92496 578 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 VGLL1Q99990 258 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 H7C2G1 150 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 NDUFS8O00217 210 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 LY6HO94772 140 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 NPYP01303 97 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 DTX2Q86UW9 622 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 TMEM158Q8WZ71 300 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 CHD9Q3L8U1 2897 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 SMKR1H3BMG3 65 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 M0R381 172 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 NDUFA4O00483 81 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 IGLV2-11P01706 119 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 DSCR9P59020 149 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 EBI3Q14213 229 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 LY6EQ16553 131 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 C9orf118A6NHY6 69 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 H7C1H1 209 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 K7EMI3 77 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 ATP5J2P56134 94 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 WFDC3Q8IUB2 231 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 CACNA1GO43497 2377 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 U3KQK5 164 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 NDUFS7O75251 213 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 KIR3DS1Q14943 382 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 TAL2Q16559 108 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 CHD7Q9P2D1 2997 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 Q8N9W7 124 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 IGHV1-69P01742 117 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 RIPPLY3P57055 190 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 SIRPDQ9H106 197 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 BUB3O43684 328 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 SLC25A16P16260 332 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 C20orf78Q9BR46 151 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 RNF182Q8N6D2 247 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 RNF114Q9Y508 228 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 TANC2Q9HCD6 1990 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 A0A1B0GV72 72 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 TEX29Q8N6K0 151 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 CADP27708 2225 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 CCL25O15444 150 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 KLK15Q9H2R5 256 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 K7EP13 123 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 IGLC6P0CF74 106 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 SPTBN2O15020 2390 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 K7EP34 96 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 FXYD7P58549 80 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 Q8N6K4 173 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 GAGE12BA1L429 117 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 CST9LQ9H4G1 147 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 HIGD1BQ9P298 99 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 ROS1P08922 2347 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 TRANK1O15050 2925 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 G3V318 75 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 MED14OSP0DP75 135 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 GATA3P23771 443 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
HERC3-201ENST00000264345 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.87□□□□□ -1.31
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