RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 SSC4DQ8WTU2 575 aa12.86□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 DOCK6Q96HP0 2047 aa12.86□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 LMO1P25800 156 aa12.86□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 MED12Q93074 2177 aa12.86□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 ATOX1O00244 68 aa12.86□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 COLCA1Q6ZS62 124 aa12.86□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa12.86□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 C3orf56Q8N813 242 aa12.85□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 SPRR3Q9UBC9 169 aa12.85□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 TRAV41A0A0B4J266 112 aa12.85□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 SIPA1L1O43166 1804 aa12.85□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 SDHAF1A6NFY7 115 aa12.85□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 EPOPA6NHQ4 379 aa12.85□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 NDUFC2O95298 119 aa12.85□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa12.84□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 DOCK8Q8NF50 2099 aa12.84□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa12.84□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 I3L3M4 83 aa12.83□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 CR1LQ2VPA4 569 aa12.83□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 C20orf78Q9BR46 151 aa12.83□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 SCN5AQ14524 2016 aa12.83□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 ZNF493Q6ZR52 646 aa12.83□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa12.83□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 LYNX1G3V0Z9 82 aa12.83□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 LYNX1P0DP58 116 aa12.83□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 K7EMI3 77 aa12.82□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 LY6DQ14210 128 aa12.82□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 LINC00527Q9UJ94 153 aa12.82□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa12.82□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 TMEM243Q9BU79 118 aa12.82□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 AKAP6Q13023 2319 aa12.82□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 INS-IGF2F8WCM5 200 aa12.82□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 H3BRN7 92 aa12.82□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 INSP01308 110 aa12.82□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa12.81□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 TMEM178BH3BS89 294 aa12.81□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 BAALC-AS2P0C853 105 aa12.81□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 K7EM74 188 aa12.81□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 THAP8Q8NA92 274 aa12.81□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 NRXN2Q9P2S2 1712 aa12.81□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 DENND4AQ7Z401 1863 aa12.81□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa12.81□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 A0A1B0GX51 115 aa12.81□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 LINC01620Q4KN68 170 aa12.81□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 OOSP1A8MZH6 123 aa12.8□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 NDUFB8O95169 186 aa12.8□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa12.8□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 MSRB2Q9Y3D2 182 aa12.8□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 SPATA12Q7Z6I5 190 aa12.8□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 ANK1P16157 1881 aa12.8□□□□□ -0.36
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CTIF-201ENST00000256413 ZNRD1Q9P1U0 126 aa12.8□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 HEATR5AQ86XA9 2040 aa12.8□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 MYLKQ15746 1914 aa12.8□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 A0A0B4J2C4 111 aa12.79□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 ARTNQ5T4W7 220 aa12.79□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 APC2O95996 2303 aa12.79□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 Q6ZUT4 128 aa12.79□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa12.79□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 IGLV3-1P01715 115 aa12.79□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 WT1-ASQ06250 92 aa12.79□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 TRPM7Q96QT4 1865 aa12.78□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 TTTY13Q9BZ97 58 aa12.78□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 DKK1O94907 266 aa12.78□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa12.78□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 RPL32P62910 135 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 HTN3P15516 51 aa12.77□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 MINOS1Q5TGZ0 78 aa12.77□□□□□ -0.36
CTIF-201ENST00000256413 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa12.77□□□□□ -0.36
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CTIF-201ENST00000256413 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 VMO1Q7Z5L0 202 aa12.77□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 WISP1O95388 367 aa12.77□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa12.77□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 C7orf69Q9H7B7 122 aa12.77□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 CRLF1O75462 422 aa12.76□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 DEFB121Q5J5C9 76 aa12.76□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 KNCNA6PVL3 124 aa12.76□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 IGHV3-53P01767 116 aa12.76□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 ZNF524Q96C55 264 aa12.76□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 SBF1O95248 1867 aa12.76□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa12.76□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa12.76□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 A4D1N5 150 aa12.75□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 C2orf70A6NJV1 201 aa12.75□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 PFN2P35080 140 aa12.75□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 MT-ATP8P03928 68 aa12.75□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 C5orf47Q569G3 176 aa12.75□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 WDR90Q96KV7 1748 aa12.75□□□□□ -0.37
CTIF-201ENST00000256413 DSCR8Q96T75 97 aa12.75□□□□□ -0.37
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