RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253339.9

LATS1-201, Transcript of large tumor suppressor kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LATS1, Length 4,256 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATS1-201ENST00000253339 DOT1LQ8TEK3 1739 aa2.86□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa2.86□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa2.86□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa2.86□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa2.86□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 HILS1P60008 231 aa2.86□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 PDE6HQ13956 83 aa2.86□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 C18orf12Q96KH6 178 aa2.86□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 KIF26BQ2KJY2 2108 aa2.86□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 ROS1P08922 2347 aa2.86□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 COL4A3Q01955 1670 aa2.86□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 TRAV5A0A0B4J249 113 aa2.86□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa2.86□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 KIAA0087Q14695 138 aa2.86□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 MORN2Q502X0 79 aa2.86□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 C9orf153Q5TBE3 101 aa2.86□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa2.86□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 LOXP28300 417 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 PSG7Q13046 419 aa2.86□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 ERCC8Q13216 396 aa2.86□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 Q6ZRP5 223 aa2.86□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 PRIMA1Q86XR5 153 aa2.86□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 CACNA1SQ13698 1873 aa2.86□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 A0A0G2JMM0 328 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 A0A1W2PPB8 328 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 KIR3DP1A8MWS1 328 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 INS-IGF2F8WCM5 200 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 INSP01308 110 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 TMEM155Q4W5P6 130 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 ZNF497Q6ZNH5 498 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 FAM216BQ8N7L0 139 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 PPDPFLQ8WWR9 84 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 LEAP2Q969E1 77 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 RMI2Q96E14 147 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 TMEM243Q9BU79 118 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 GFRA4Q9GZZ7 299 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 PRORYQ9H606 182 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 SDK2Q58EX2 2172 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 HEATR5AQ86XA9 2040 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 IGHV3-48P01763 117 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 SPINK8P0C7L1 97 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 CSRP3P50461 194 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 SLC25A45Q8N413 288 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 ANKRD29Q8N6D5 301 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 TIMM21Q9BVV7 248 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 TMEM126AQ9H061 195 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 PLCH1Q4KWH8 1693 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 TRAV41A0A0B4J266 112 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 H3BQ85 93 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 TCRAP04437 139 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 RNF138Q8WVD3 245 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 UBE2WQ96B02 151 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 TMEM141Q96I45 108 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 TIMM17AQ99595 171 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 CYTL1Q9NRR1 136 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 RREB1Q92766 1687 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 WDR81Q562E7 1941 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 SCN8AQ9UQD0 1980 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 ZNF407Q9C0G0 2248 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 A0A0J9YXY3 114 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 SRRM5B3KS81 715 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 SHISA9B4DS77 424 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 K7EP13 123 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 M0R1W7 72 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 NXPH4O95158 308 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 SCRT2Q9NQ03 307 aa2.85□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa2.84□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 SCN5AQ14524 2016 aa2.84□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 FAM223BA6NKX1 122 aa2.84□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 PSCAO43653 123 aa2.84□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 PROP1O75360 226 aa2.84□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 MMP23AO75900 390 aa2.84□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 FSHBP01225 129 aa2.84□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa2.84□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa2.84□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 LINC01551Q86U37 167 aa2.84□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 FAM223AQ8IWN6 122 aa2.84□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 IMMP1LQ96LU5 166 aa2.84□□□□□ -1.95
LATS1-201ENST00000253339 PRO0628Q9UI54 55 aa2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms