RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 H3BQ15 152 aa14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 SLC17A3O00476 420 aa14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 CST7O76096 145 aa14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 S100A10P60903 97 aa14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 MIC13Q5XKP0 118 aa14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 PFDN5Q99471 154 aa14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 MED9Q9NWA0 146 aa14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 OR5AC2Q9NZP5 309 aa14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 FAM24AA6NFZ4 105 aa14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 E5RGE8 158 aa14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 TAAR5O14804 337 aa14.73□□□□□ -0.05
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NEDD8-201ENST00000250495 RNF141Q8WVD5 230 aa14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 WDR83OSQ9Y284 106 aa14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 TRAV5A0A0B4J249 113 aa14.72□□□□□ -0.05
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NEDD8-201ENST00000250495 C11orf1Q9H5F2 150 aa14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 LINC00588Q9Y4M8 146 aa14.72□□□□□ -0.05
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NEDD8-201ENST00000250495 C6orf223Q8N319 242 aa14.71□□□□□ -0.05
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NEDD8-201ENST00000250495 HBG2P69892 147 aa14.7□□□□□ -0.06
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NEDD8-201ENST00000250495 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-201ENST00000250495 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
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NEDD8-201ENST00000250495 STX12Q86Y82 276 aa14.69□□□□□ -0.06
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NEDD8-201ENST00000250495 GAGE7O76087 117 aa14.67□□□□□ -0.06
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NEDD8-201ENST00000250495 GAGE12GP0CL81 117 aa14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-201ENST00000250495 GAGE12IP0CL82 117 aa14.67□□□□□ -0.06
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NEDD8-201ENST00000250495 TMEM14CQ9P0S9 112 aa14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-201ENST00000250495 PRELID1Q9Y255 219 aa14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-201ENST00000250495 PCLOQ9Y6V0 5065 aa14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-201ENST00000250495 TRBV19A0A075B6N1 114 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-201ENST00000250495 IGSF23A1L1A6 192 aa14.66□□□□□ -0.06
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NEDD8-201ENST00000250495 M0R3E3 92 aa14.63□□□□□ -0.07
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NEDD8-201ENST00000250495 SLC25A31Q9H0C2 315 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-201ENST00000250495 AAMDCQ9H7C9 122 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-201ENST00000250495 KLLNB2CW77 178 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-201ENST00000250495 ESRGQ1W209 222 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-201ENST00000250495 Q6ZTI0 123 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-201ENST00000250495 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-201ENST00000250495 BLNKQ8WV28 456 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-201ENST00000250495 LINC00467Q9BRT7 94 aa14.61□□□□□ -0.07
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