RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		0.29	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	GPR31	O00270	319 aa		0.29	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	PPP1R2	P41236	205 aa		0.29	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	RTL8B	Q17RB0	113 aa		0.29	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		0.29	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		0.29	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	SMR3A	Q99954	134 aa		0.29	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		0.29	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	PIK3C2A	O00443	1686 aa		0.29	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	RTL9	Q8NET4	1388 aa		0.29	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		0.28	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		0.28	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175		A0A0J9YY99	117 aa		0.28	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	CST7	O76096	145 aa		0.28	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	GLRX	P35754	106 aa		0.28	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	TAS2R41	P59536	307 aa		0.28	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	FXYD4	P59646	89 aa		0.28	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		0.28	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		0.28	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		0.28	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	OTOR	Q9NRC9	128 aa		0.28	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	PTPRD	P23468	1912 aa		0.28	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		0.27	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175		A6NN06	94 aa		0.27	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM238	C9JI98	176 aa		0.27	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		0.27	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	TCTA	P57738	103 aa		0.27	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		0.27	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		0.27	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	PRR15	Q8IV56	129 aa		0.27	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		0.27	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		0.27	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		0.27	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	CST11	Q9H112	138 aa		0.27	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	IL20	Q9NYY1	176 aa		0.27	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	MYH3	P11055	1940 aa		0.26	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		0.26	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175		A0A096LPI6	279 aa		0.26	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF727	A8MUV8	499 aa		0.26	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175		H3BQV1	296 aa		0.26	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	PDE6G	P18545	87 aa		0.26	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		0.26	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		0.26	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	NIT2	Q9NQR4	276 aa		0.26	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	BIN3	Q9NQY0	253 aa		0.26	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		0.26	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		0.26	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		0.26	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		0.25	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	CRYBA4	P53673	196 aa		0.25	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		0.25	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	STX19	Q8N4C7	294 aa		0.25	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	DIRC1	Q969H9	104 aa		0.25	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	BORCS8	Q96FH0	119 aa		0.25	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	MCEE	Q96PE7	176 aa		0.25	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	LIMD2	Q9BT23	127 aa		0.25	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		0.24	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	MDN1	Q9NU22	5596 aa		0.24	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		0.24	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	NUPR2	A6NF83	97 aa		0.24	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	IGHV3-30	P01768	117 aa		0.24	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		0.24	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	CCL4	P13236	92 aa		0.24	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF137P	P52743	207 aa		0.24	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175		Q6ZQY7	126 aa		0.24	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175		Q6ZS92	163 aa		0.24	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		0.24	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	NEK7	Q8TDX7	302 aa		0.24	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	PLAC4	Q8WY50	150 aa		0.24	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	OR4C12	Q96R67	309 aa		0.24	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		0.24	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	GID8	Q9NWU2	228 aa		0.24	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		0.24	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		0.24	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	TECPR2	O15040	1411 aa		0.23	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		0.23	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	PPP5D1	E7EU14	171 aa		0.23	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175		H7BYZ3	331 aa		0.23	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	SERPINB1	P30740	379 aa		0.23	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	SPINT3	P49223	89 aa		0.23	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		0.23	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		0.23	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	C10orf111	Q8N326	155 aa		0.23	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	CCL19	Q99731	98 aa		0.23	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	MED11	Q9P086	117 aa		0.23	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	JPT1	Q9UK76	154 aa		0.23	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	SYNM	O15061	1565 aa		0.23	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		0.23	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	ROCK1	Q13464	1354 aa		0.22	□□□□□ -2.37
ATRX-223	ENST00000637175	MT-ND6	P03923	174 aa		0.22	□□□□□ -2.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms