RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 CCNKO75909 580 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 MCFD2Q8NI22 146 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 FUT9Q9Y231 359 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A087WTM6 91 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 FABP12A6NFH5 140 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 GOSR2O14653 212 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 PAX4O43316 350 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 NPVFQ9HCQ7 196 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 PXMP4Q9Y6I8 212 aa18.68■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa18.67■□□□□ 0.58
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CAPNS1-217ENST00000629983 CT45A10P0DMU9 189 aa18.67■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 TEPPQ6URK8 271 aa18.67■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF680Q8NEM1 530 aa18.67■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM229AH3BQW9 127 aa18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 METTL15P1P0C7V9 234 aa18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 AP3S2P59780 193 aa18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 PXDC1Q5TGL8 231 aa18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF546Q86UE3 836 aa18.66■□□□□ 0.58
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CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV3-53P01767 116 aa18.65■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 ID3Q02535 119 aa18.65■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 OR10P1Q8NGE3 313 aa18.65■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 ODF3Q96PU9 254 aa18.65■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
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CAPNS1-217ENST00000629983 HAMPP81172 84 aa18.64■□□□□ 0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa18.63■□□□□ 0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 NPIPB6E9PJ23 425 aa18.63■□□□□ 0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 J3QL48 77 aa18.63■□□□□ 0.57
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CAPNS1-217ENST00000629983 SCGB1D2O95969 90 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 TNFSF8P32971 234 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZSN1 163 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 C11orf72Q8NBR9 251 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 SMIM8Q96KF7 97 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 FNDC10F2Z333 226 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 AGPAT2O15120 278 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 OPCMLQ14982 345 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 PYDC2Q56P42 97 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 MORN5Q5VZ52 161 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 C10orf113Q5VZT2 155 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 LY96Q9Y6Y9 160 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 H3BQ15 152 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
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CAPNS1-217ENST00000629983 SOSTQ9BQB4 213 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 KLF12Q9Y4X4 402 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLC2P0DOY2 106 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 LYPD5Q6UWN5 251 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00467Q9BRT7 94 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 MSRB1Q9NZV6 116 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 PRO0255Q9UI72 69 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 ERCC8Q13216 396 aa18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 BTN1A1Q13410 526 aa18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM37Q8WXS4 190 aa18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 ST6GAL2Q96JF0 529 aa18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 SPINK4O60575 86 aa18.57■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB2BQ8WUD1 216 aa18.57■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 C8orf49Q96NF6 230 aa18.57■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 TCL1AP56279 114 aa18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 GUK1Q16774 197 aa18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV5A0A0B4J249 113 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 C9orf170A2RU37 121 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 PRAF2O60831 178 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 EVI2AP22794 236 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 CD300CQ08708 224 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 SLAQ13239 276 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 NEGR1Q7Z3B1 354 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 MGST2Q99735 147 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 HHLA3Q9XRX5 114 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 CRYBA4P53673 196 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 RGS13O14921 159 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 TSC22D2O75157 780 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 MPDU1O75352 247 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 ARL16Q0P5N6 197 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZRG5 221 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 WFDC10BQ8IUB3 73 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 ARPC5LQ9BPX5 153 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 M0R3E3 92 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 NOL3O60936 208 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
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