RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620466.4

ALMS1-208, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 2

Gene ALMS1, Length 6,720 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-208ENST00000620466 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.7□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 TMEM155Q4W5P6 130 aa6.7□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.7□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.7□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 PAX4O43316 350 aa6.7□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 SS18Q15532 418 aa6.7□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 AMN1Q8IY45 258 aa6.7□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 C11orf52Q96A22 123 aa6.7□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 NDUFS8O00217 210 aa6.7□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.7□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 LINC01619G3V211 115 aa6.7□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa6.7□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 SPRNQ5BIV9 151 aa6.7□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.7□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.7□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 OOSP1A8MZH6 123 aa6.69□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 CFHR3Q02985 330 aa6.69□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 UBE2V1Q13404 147 aa6.69□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.69□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 TMEM238C9JI98 176 aa6.69□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.69□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 IGLV2-14P01704 120 aa6.69□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.69□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 CSTL1Q9H114 145 aa6.69□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 NUP210LQ5VU65 1888 aa6.69□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 PRR20EP86478 221 aa6.69□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 PRR20CP86479 221 aa6.69□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 PRR20DP86480 221 aa6.69□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 PRR20BP86481 221 aa6.69□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 PRR20AP86496 221 aa6.69□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 WT1-ASQ06250 92 aa6.69□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.69□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 LINC00477Q96M19 166 aa6.69□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 DENND4AQ7Z401 1863 aa6.69□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa6.69□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 ERG28Q9UKR5 140 aa6.69□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 LEPROTO15243 131 aa6.68□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.68□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 FXYD5Q96DB9 178 aa6.68□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 COX11Q9Y6N1 276 aa6.68□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.68□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 TMEM213A2RRL7 107 aa6.68□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 LY6HO94772 140 aa6.68□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 SAA4P35542 130 aa6.68□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.68□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 SMPXQ9UHP9 88 aa6.68□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.68□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 CFHR2P36980 270 aa6.68□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.68□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 DOCK8Q8NF50 2099 aa6.68□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 A0A087WWL8 130 aa6.68□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 CT83Q5H943 113 aa6.68□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 THAP8Q8NA92 274 aa6.68□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 SYNJ2BPP57105 145 aa6.68□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 PLA2G2CQ5R387 149 aa6.68□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.68□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 IGLC2P0DOY2 106 aa6.68□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 IGLC3P0DOY3 106 aa6.68□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 DEFB130BP0DP73 79 aa6.68□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 DEFB130AP0DP74 79 aa6.68□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 ASXL3Q9C0F0 2248 aa6.67□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 GAGE2EQ4V326 116 aa6.67□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.67□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.67□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.67□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.67□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 TMEM158Q8WZ71 300 aa6.67□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 SDK2Q58EX2 2172 aa6.67□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 NPSP0C0P6 89 aa6.67□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.67□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 EP400Q96L91 3159 aa6.67□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.67□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 LINC00311Q8N616 119 aa6.67□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.67□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 LINC01549A6NIU2 74 aa6.66□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 VCYO14598 125 aa6.66□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 MSMBP08118 114 aa6.66□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 DAD1P61803 113 aa6.66□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 FAM231BA6NCW3 169 aa6.66□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 A8MWV9 139 aa6.66□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 KIR3DS1Q14943 382 aa6.66□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 ZNF479Q96JC4 524 aa6.66□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 FAM215AQ9Y5M1 114 aa6.66□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 H3BRN7 92 aa6.66□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 LINC01559Q495D7 138 aa6.66□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.66□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.66□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 CGB3P0DN86 165 aa6.66□□□□□ -1.34
ALMS1-208ENST00000620466 PDE6HQ13956 83 aa6.66□□□□□ -1.34
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