RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 PRR25Q96S07 402 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 DNHD1Q96M86 4753 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A087X0K7 114 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAV34A0A0B4J273 112 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM74A7A6NL05 159 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 IGKV3-20P01619 116 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 CEBPGP53567 150 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 DEFB131AP59861 70 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 PSMG4Q5JS54 123 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 C1orf194Q5T5A4 169 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 C9orf66Q5T8R8 295 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 COMMD7Q86VX2 200 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF738Q8NE65 137 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 WFDC9Q8NEX5 89 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC20Q8TCA0 184 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 C16orf92Q96LL3 132 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 MAP6D1Q9H9H5 199 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 NRN1Q9NPD7 142 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 WNK1Q9H4A3 2382 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 HELTA6NFD8 242 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 RBFOX3A6NFN3 312 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 TSPAN4O14817 238 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 HBE1P02100 147 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 BCL2P10415 239 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 FXYD7P58549 80 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 CD81P60033 236 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB14P61106 215 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 GUK1Q16774 197 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 SYT8Q8NBV8 401 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 LYPD6BQ8NI32 183 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 Q8TAT8 98 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 SUN5Q8TC36 379 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00479Q96M42 142 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR82Q96P67 336 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM167BQ9NRX6 74 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 PFDN2Q9UHV9 154 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 NF1P21359 2839 aa4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB19A4D1S5 217 aa4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 PGPEP1LA6NFU8 196 aa4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 C11orf94C9JXX5 98 aa4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 J3KRW8 73 aa4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 SRP19P09132 144 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 BMI1P35226 326 aa4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 PSMB3P49720 205 aa4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 KIR3DS1Q14943 382 aa4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 PSG3Q16557 428 aa4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF674Q2M3X9 581 aa4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 BEAN1Q3B7T3 259 aa4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF506Q5JVG8 444 aa4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 PRR31Q5SQ13 230 aa4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 LCN12Q6JVE5 192 aa4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 DEFB125Q8N687 156 aa4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 NHLRC2Q8NBF2 726 aa4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM210AQ96ND0 272 aa4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 VGLL1Q99990 258 aa4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC50A1Q9BRV3 221 aa4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 DERL1Q9BUN8 251 aa4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 TREM1Q9NP99 234 aa4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa4.47□□□□□ -1.69
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAV25A0A0B4J276 109 aa4.46□□□□□ -1.7
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00862A6NCI5 91 aa4.46□□□□□ -1.7
CAPNS1-208ENST00000589162 OR4C46A6NHA9 309 aa4.46□□□□□ -1.7
CAPNS1-208ENST00000589162 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
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CAPNS1-208ENST00000589162 PPT1P50897 306 aa4.46□□□□□ -1.7
CAPNS1-208ENST00000589162 ACTL10Q5JWF8 245 aa4.46□□□□□ -1.7
CAPNS1-208ENST00000589162 Q6ZQT7 251 aa4.46□□□□□ -1.7
CAPNS1-208ENST00000589162 S100A7AQ86SG5 101 aa4.46□□□□□ -1.7
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC28AQ8IWP9 274 aa4.46□□□□□ -1.7
CAPNS1-208ENST00000589162 Q8N1Y9 231 aa4.46□□□□□ -1.7
CAPNS1-208ENST00000589162 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa4.46□□□□□ -1.7
CAPNS1-208ENST00000589162 SVIPQ8NHG7 77 aa4.46□□□□□ -1.7
CAPNS1-208ENST00000589162 C8orf49Q96NF6 230 aa4.46□□□□□ -1.7
CAPNS1-208ENST00000589162 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
CAPNS1-208ENST00000589162 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR61Q9BZJ8 451 aa4.46□□□□□ -1.7
CAPNS1-208ENST00000589162 AAMDCQ9H7C9 122 aa4.46□□□□□ -1.7
CAPNS1-208ENST00000589162 MANBALQ9NQG1 85 aa4.46□□□□□ -1.7
CAPNS1-208ENST00000589162 OTORQ9NRC9 128 aa4.46□□□□□ -1.7
CAPNS1-208ENST00000589162 VAX2Q9UIW0 290 aa4.46□□□□□ -1.7
CAPNS1-208ENST00000589162 EPDR1Q9UM22 224 aa4.46□□□□□ -1.7
CAPNS1-208ENST00000589162 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1W2PRE2 83 aa4.45□□□□□ -1.7
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