RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 GPHB5Q86YW7 130 aa5.58□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa5.58□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 LINC00479Q96M42 142 aa5.58□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 KMT2AQ03164 3969 aa5.58□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM213A2RRL7 107 aa5.57□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 IZUMO1RA6ND01 250 aa5.57□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 C2orf70A6NJV1 201 aa5.57□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 FAM25EA8MYX2 175 aa5.57□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 H3BP45 60 aa5.57□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 LGALS9O00182 355 aa5.57□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 WRBO00258 174 aa5.57□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 SYNGR2O43760 224 aa5.57□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 SSSCA1O60232 199 aa5.57□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 GNG7O60262 68 aa5.57□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 IGLV1-51P01701 117 aa5.57□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP5.57□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 PPP1R14BQ96C90 147 aa5.57□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 C20orf24Q9BUV8 137 aa5.57□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 GSKIPQ9P0R6 139 aa5.57□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1B0GVG6 124 aa5.56□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 A8MWP6 167 aa5.56□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 CORTO00230 105 aa5.56□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 NDUFA4O00483 81 aa5.56□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 GIPP09681 153 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 FOLR2P14207 255 aa5.56□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 RND2P52198 227 aa5.56□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa5.56□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 PRSS54Q6PEW0 395 aa5.56□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 SLC16A13Q7RTY0 426 aa5.56□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 AKAP14Q86UN6 197 aa5.56□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 Q8N377 158 aa5.56□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 DYNLRB2Q8TF09 96 aa5.56□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 ACY3Q96HD9 319 aa5.56□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 U3KQ87 197 aa5.56□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa5.55□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 E9PLD3 99 aa5.55□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 GOSR2O14653 212 aa5.55□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 PFDN1O60925 122 aa5.55□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 MED6O75586 246 aa5.55□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 CCNKO75909 580 aa5.55□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 YIF1AO95070 293 aa5.55□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 SIX6O95475 246 aa5.55□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM50AO95807 157 aa5.55□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 IFNA4P05014 189 aa5.55□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 CBLN1P23435 193 aa5.55□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 FCN2Q15485 313 aa5.55□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 SPANXN5Q5MJ07 72 aa5.55□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.55□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 GSG1LQ6UXU4 331 aa5.55□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 OR4X1Q8NH49 305 aa5.55□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 UFC1Q9Y3C8 167 aa5.55□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa5.54□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa5.54□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa5.54□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa5.54□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa5.54□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 H7C423 109 aa5.54□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 K7EPK0 472 aa5.54□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 ATP5LO75964 103 aa5.54□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 IGKV1-17P01599 117 aa5.54□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 IGLC1P0CG04 106 aa5.54□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 OR10J1P30954 320 aa5.54□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 S100A10P60903 97 aa5.54□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 RAB11AP62491 216 aa5.54□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 GUCA2BQ16661 112 aa5.54□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 DEFB114Q30KQ6 69 aa5.54□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 UFSP1Q6NVU6 142 aa5.54□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 TOMM20LQ6UXN7 152 aa5.54□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF600Q6ZNG1 722 aa5.54□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 TCTE3Q8IZS6 198 aa5.54□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM61Q8N0U2 210 aa5.54□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 OR11H7Q8NGC8 314 aa5.54□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 C2orf50Q96LR7 162 aa5.54□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 NMES1Q9C002 83 aa5.54□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 PSENENQ9NZ42 101 aa5.54□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.54□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa5.53□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa5.53□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 NDUFAF8A1L188 74 aa5.53□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 PET100P0DJ07 73 aa5.53□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 C8orf88P0DMB2 117 aa5.53□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 SLC25A4P12235 298 aa5.53□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 CXCL3P19876 107 aa5.53□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 H2BFSP57053 126 aa5.53□□□□□ -1.52
ATG4D-210ENST00000588972 LCN12Q6JVE5 192 aa5.53□□□□□ -1.52
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