RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 SGK494Q96LW2 274 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 TPPP3Q9BW30 176 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 Q9UFV3 132 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 KNTC1P50748 2209 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 H3BUT2 72 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 GOSR1O95249 250 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 PRTN3P24158 256 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 NMUP48645 174 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 CRIP1P50238 77 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF138P52744 262 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 ODF1Q14990 250 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 CFHR4Q92496 578 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 ABHD17AQ96GS6 310 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 VGLL1Q99990 258 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 ODF3BA8MYP8 253 aa6.04□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 M0R381 172 aa6.04□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 TIMM23O14925 209 aa6.04□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 TNFRSF6BO95407 300 aa6.04□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 NPYP01303 97 aa6.04□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 PRSS1P07477 247 aa6.04□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 LAGE3Q14657 143 aa6.04□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 GFRALQ6UXV0 394 aa6.04□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.04□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 Q6ZVH6 145 aa6.04□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 CEND1Q8N111 149 aa6.04□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 DEFB123Q8N688 67 aa6.04□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.04□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.04□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 C20orf78Q9BR46 151 aa6.04□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.03□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa6.03□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.03□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM238C9JI98 176 aa6.03□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 E7EQL1 145 aa6.03□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 E9PLD3 99 aa6.03□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 NCR2O95944 276 aa6.03□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 ORM1P02763 201 aa6.03□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 LEPP41159 167 aa6.03□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.03□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 Q8N6K4 173 aa6.03□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 DEFB124Q8NES8 71 aa6.03□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 PRSS33Q8NF86 280 aa6.03□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.03□□□□□ -1.44
CAPNS1-202ENST00000586851 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.03□□□□□ -1.44
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CAPNS1-202ENST00000586851 A0A087WX48 190 aa6.02□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.02□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.02□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1B0GV72 72 aa6.02□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1B0GWB2 263 aa6.02□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM213A2RRL7 107 aa6.02□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 F8VRH5 84 aa6.02□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 H3BTX0 84 aa6.02□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 H7C1H1 209 aa6.02□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 SNAI2O43623 268 aa6.02□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM106CPP0CH98 169 aa6.02□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 GCSHP23434 173 aa6.02□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 COL8A2P25067 703 aa6.02□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 CNTFRP26992 372 aa6.02□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 UQCRFS1P47985 274 aa6.02□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 TCTAP57738 103 aa6.02□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.02□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 RNF185Q96GF1 192 aa6.02□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 C8orf49Q96NF6 230 aa6.02□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.02□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.02□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 XIRP2A4UGR9 3374 aa6.01□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.01□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.01□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.01□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 OR11H12B2RN74 326 aa6.01□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 M0R3E3 92 aa6.01□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 BRI3O95415 125 aa6.01□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 COX7A1P24310 79 aa6.01□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 CD24P25063 80 aa6.01□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.01□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 OR11H1Q8NG94 326 aa6.01□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 OR11H2Q8NH07 326 aa6.01□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.01□□□□□ -1.45
CAPNS1-202ENST00000586851 METTL26Q96S19 204 aa6.01□□□□□ -1.45
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