RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		18.31	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		18.31	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	NDUFB4	O95168	129 aa		18.3	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	C4BPB	P20851	252 aa		18.3	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		18.3	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	ICAM4	Q14773	271 aa		18.29	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	BAP18	Q8IXM2	172 aa		18.29	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		18.29	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	COL7A1	Q02388	2944 aa		18.28	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	SPRY2	O43597	315 aa		18.28	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	STAG3L2	P0CL84	134 aa		18.28	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	STAG3L3	P0CL85	134 aa		18.28	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229		Q6ZWC4	215 aa		18.28	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	SSX7	Q7RTT5	188 aa		18.28	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		18.28	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		18.27	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229		M0R3E3	92 aa		18.27	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	SEC11B	P0C7V7	166 aa		18.27	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		18.27	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	TMED6	Q8WW62	240 aa		18.27	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	XCL2	Q9UBD3	114 aa		18.27	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	PRELID1	Q9Y255	219 aa		18.27	■□□□□ 0.52
GPS1-223	ENST00000584229	PRAC2	D3DTV9	90 aa		18.26	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229	CXorf1	O96002	111 aa		18.26	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		18.26	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		18.26	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229		Q9H3A6	140 aa		18.26	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229	GCHFR	P30047	84 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229	STOML3	Q8TAV4	291 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229	RNF183	Q96D59	192 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF726P1	Q15940	193 aa		18.24	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		18.24	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		18.24	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229	CSN1S1	P47710	185 aa		18.23	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229	SLC51B	Q86UW2	128 aa		18.23	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		18.23	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		18.22	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229	UMAD1	C9J7I0	102 aa		18.22	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229	FHIT	P49789	147 aa		18.22	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		18.22	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		18.22	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		18.22	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		18.22	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229		M0R2Z0	102 aa		18.21	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		18.21	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		18.21	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		18.21	■□□□□ 0.51
GPS1-223	ENST00000584229	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
GPS1-223	ENST00000584229	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		18.2	■□□□□ 0.5
GPS1-223	ENST00000584229	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
GPS1-223	ENST00000584229	OR11H2	Q8NH07	326 aa		18.2	■□□□□ 0.5
GPS1-223	ENST00000584229	RARRES2	Q99969	163 aa		18.2	■□□□□ 0.5
GPS1-223	ENST00000584229	OTOR	Q9NRC9	128 aa		18.2	■□□□□ 0.5
GPS1-223	ENST00000584229	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		18.2	■□□□□ 0.5
GPS1-223	ENST00000584229	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		18.19	■□□□□ 0.5
GPS1-223	ENST00000584229	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		18.19	■□□□□ 0.5
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1B0GV50	99 aa		18.19	■□□□□ 0.5
GPS1-223	ENST00000584229	PGP	A6NDG6	321 aa		18.19	■□□□□ 0.5
GPS1-223	ENST00000584229	ERCC8	Q13216	396 aa		18.19	■□□□□ 0.5
GPS1-223	ENST00000584229	AMTN	Q6UX39	209 aa		18.19	■□□□□ 0.5
GPS1-223	ENST00000584229	TENM3	Q9P273	2699 aa		18.19	■□□□□ 0.5
GPS1-223	ENST00000584229	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		18.18	■□□□□ 0.5
GPS1-223	ENST00000584229		A8MTW9	85 aa		18.17	■□□□□ 0.5
GPS1-223	ENST00000584229		J3KRW8	73 aa		18.17	■□□□□ 0.5
GPS1-223	ENST00000584229	UBE2G2	P60604	165 aa		18.17	■□□□□ 0.5
GPS1-223	ENST00000584229	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		18.17	■□□□□ 0.5
GPS1-223	ENST00000584229	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		18.16	■□□□□ 0.5
GPS1-223	ENST00000584229	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		18.16	■□□□□ 0.5
GPS1-223	ENST00000584229	AMBP	P02760	352 aa		18.16	■□□□□ 0.5
GPS1-223	ENST00000584229	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		18.16	■□□□□ 0.5
GPS1-223	ENST00000584229	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		18.16	■□□□□ 0.5
GPS1-223	ENST00000584229	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		18.16	■□□□□ 0.5
GPS1-223	ENST00000584229	INS	P01308	110 aa		18.15	■□□□□ 0.5
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		18.15	■□□□□ 0.5
GPS1-223	ENST00000584229	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		18.15	■□□□□ 0.5
GPS1-223	ENST00000584229	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		18.14	■□□□□ 0.49
GPS1-223	ENST00000584229	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		18.14	■□□□□ 0.49
GPS1-223	ENST00000584229	VGLL1	Q99990	258 aa		18.14	■□□□□ 0.49
GPS1-223	ENST00000584229	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		18.14	■□□□□ 0.49
GPS1-223	ENST00000584229	CT45A10	P0DMU9	189 aa		18.13	■□□□□ 0.49
GPS1-223	ENST00000584229	TSPO	P30536	169 aa		18.13	■□□□□ 0.49
GPS1-223	ENST00000584229	LEP	P41159	167 aa		18.13	■□□□□ 0.49
GPS1-223	ENST00000584229	CDKN1B	P46527	198 aa		18.13	■□□□□ 0.49
GPS1-223	ENST00000584229	GNG5	P63218	68 aa		18.13	■□□□□ 0.49
GPS1-223	ENST00000584229	SUN5	Q8TC36	379 aa		18.13	■□□□□ 0.49
GPS1-223	ENST00000584229	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		18.13	■□□□□ 0.49
GPS1-223	ENST00000584229		A0A0J9YWU9	116 aa		18.12	■□□□□ 0.49
GPS1-223	ENST00000584229	DIRC3	C9JPN6	131 aa		18.12	■□□□□ 0.49
GPS1-223	ENST00000584229	RAB5C	P51148	216 aa		18.12	■□□□□ 0.49

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