RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRELID1Q9Y255 219 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 TENM3Q9P273 2699 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGKV3-20P01619 116 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 C4BPBP20851 252 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEFB135Q30KP9 77 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR8A1Q8NGG7 326 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 PHYHIPLQ96FC7 376 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 RCHY1Q96PM5 261 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 RETNQ9HD89 108 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 U3KQK5 164 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 CNN1P51911 297 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 LYPD1Q8N2G4 141 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 A8MTW9 85 aa24.24■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 UMAD1C9J7I0 102 aa24.24■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF726P1Q15940 193 aa24.24■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 SSX7Q7RTT5 188 aa24.24■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 CXorf1O96002 111 aa24.23■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 ICAM4Q14773 271 aa24.23■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC51BQ86UW2 128 aa24.23■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 M0R3E3 92 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 RANP62826 216 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMED6Q8WW62 240 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF183Q96D59 192 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 OVOL2Q9BRP0 275 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPRY2O43597 315 aa24.21■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRAC2D3DTV9 90 aa24.2■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 GCHFRP30047 84 aa24.2■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q9H3A6 140 aa24.2■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa24.2■■□□□ 1.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 STAB2Q8WWQ8 2551 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR10J6PQ8NGY7 276 aa24.2■■□□□ 1.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 AMTNQ6UX39 209 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 SUN5Q8TC36 379 aa24.19■■□□□ 1.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC35B3Q9H1N7 401 aa24.18■■□□□ 1.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM167BQ9NRX6 74 aa24.18■■□□□ 1.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 FHITP49789 147 aa24.17■■□□□ 1.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 XCL2Q9UBD3 114 aa24.17■■□□□ 1.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 DPPA3Q6W0C5 159 aa24.16■■□□□ 1.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 FXYD7P58549 80 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 OTORQ9NRC9 128 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM74A1Q5RGS3 127 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 IQCF2Q8IXL9 164 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa24.15■■□□□ 1.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 CSN1S1P47710 185 aa24.14■■□□□ 1.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM213BQ8TBF2 198 aa24.14■■□□□ 1.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa24.14■■□□□ 1.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 PGPA6NDG6 321 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPIPB6E9PJ23 425 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 RARRES2Q99969 163 aa24.12■■□□□ 1.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 AMBPP02760 352 aa24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB5CP51148 216 aa24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 RXFP4Q8TDU9 374 aa24.11■■□□□ 1.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPINK13Q1W4C9 94 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 M0R2Z0 102 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR11H2Q8NH07 326 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 CMTM2Q8TAZ6 248 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 MBD3L1Q8WWY6 194 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa24.1■■□□□ 1.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 SFT2D1Q8WV19 159 aa24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00477Q96M19 166 aa24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 ODF3Q96PU9 254 aa24.08■■□□□ 1.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDKN1BP46527 198 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 SULT1A2P50226 295 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PRE2 83 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBAKDNA6NC62 111 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 DIRC3C9JPN6 131 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRXO43186 299 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 H2AFB1P0C5Y9 115 aa24.05■■□□□ 1.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 CT45A10P0DMU9 189 aa24.05■■□□□ 1.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERCC8Q13216 396 aa24.05■■□□□ 1.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSPOP30536 169 aa24.05■■□□□ 1.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM78Q5T7P6 136 aa24.05■■□□□ 1.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 VGLL1Q99990 258 aa24.05■■□□□ 1.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 BOLA1Q9Y3E2 137 aa24.05■■□□□ 1.44
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