RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 PAX9P55771 341 aa5.19□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF90Q03938 601 aa5.19□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 ICAM4Q14773 271 aa5.19□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 KHDC3LQ587J8 217 aa5.19□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 GDF5OSQ5U4N7 250 aa5.19□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 TVP23CQ96ET8 276 aa5.19□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.19□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 HYDINQ4G0P3 5121 aa5.18□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa5.18□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa5.18□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A087WWC5 75 aa5.18□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRAV10A0A0B4J240 114 aa5.18□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa5.18□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa5.18□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 H3BQ15 152 aa5.18□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 BUB3O43684 328 aa5.18□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 SYNGR2O43760 224 aa5.18□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP5.18□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCL20P78556 96 aa5.18□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 GAMTQ14353 236 aa5.18□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR10G4Q8NGN3 311 aa5.18□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 ISOC2Q96AB3 205 aa5.18□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 PSENENQ9NZ42 101 aa5.18□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 APLNQ9ULZ1 77 aa5.18□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 RFNGQ9Y644 331 aa5.18□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 B4DEV8 164 aa5.17□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 C11orf94C9JXX5 98 aa5.17□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 F6UB75 175 aa5.17□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 H3BMM0 161 aa5.17□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 H3BP45 60 aa5.17□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 IFNA1P01562 189 aa5.17□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 HLA-DRB4P13762 266 aa5.17□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 CEBPGP53567 150 aa5.17□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 B2MP61769 119 aa5.17□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 HBG1P69891 147 aa5.17□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 HBG2P69892 147 aa5.17□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 CTAG1AP78358 180 aa5.17□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 FABP9Q0Z7S8 132 aa5.17□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM41BQ5BJD5 291 aa5.17□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR8G2PQ6IF36 304 aa5.17□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa5.17□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR4B1Q8NGF8 309 aa5.17□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 MBD3L1Q8WWY6 194 aa5.17□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 YPEL4Q96NS1 127 aa5.17□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa5.17□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC25A22Q9H936 323 aa5.17□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa5.17□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa5.16□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa5.16□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 SMCO3A2RU48 225 aa5.16□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 FABP1P07148 127 aa5.16□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 HTN3P15516 51 aa5.16□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 ID1P41134 155 aa5.16□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAB11AP62491 216 aa5.16□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 DLK1P80370 383 aa5.16□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 SERF2P84101 59 aa5.16□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF674Q2M3X9 581 aa5.16□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR8I2Q8N0Y5 310 aa5.16□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa5.16□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa5.16□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa5.16□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 DOK5Q9P104 306 aa5.16□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 GNG13Q9P2W3 67 aa5.16□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 TIMM9Q9Y5J7 89 aa5.16□□□□□ -1.58
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF727A8MUV8 499 aa5.15□□□□□ -1.59
CCNDBP1-212ENST00000567690 SOCS3O14543 225 aa5.15□□□□□ -1.59
CCNDBP1-212ENST00000567690 METTL15P1P0C7V9 234 aa5.15□□□□□ -1.59
CCNDBP1-212ENST00000567690 BCL2P10415 239 aa5.15□□□□□ -1.59
CCNDBP1-212ENST00000567690 ORM2P19652 201 aa5.15□□□□□ -1.59
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
CCNDBP1-212ENST00000567690 RPS10P46783 165 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
CCNDBP1-212ENST00000567690 PSMB3P49720 205 aa5.15□□□□□ -1.59
CCNDBP1-212ENST00000567690 TCTAP57738 103 aa5.15□□□□□ -1.59
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC38A11Q08AI6 406 aa5.15□□□□□ -1.59
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATP6V1FQ16864 119 aa5.15□□□□□ -1.59
CCNDBP1-212ENST00000567690 C12orf74Q32Q52 190 aa5.15□□□□□ -1.59
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPANXN5Q5MJ07 72 aa5.15□□□□□ -1.59
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM78BQ5VT40 261 aa5.15□□□□□ -1.59
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGFL4Q6B9Z1 124 aa5.15□□□□□ -1.59
CCNDBP1-212ENST00000567690 FOXI2Q6ZQN5 318 aa5.15□□□□□ -1.59
CCNDBP1-212ENST00000567690 C20orf173Q96LM9 149 aa5.15□□□□□ -1.59
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRGV9Q99603 122 aa5.15□□□□□ -1.59
CCNDBP1-212ENST00000567690 RSG1Q9BU20 258 aa5.15□□□□□ -1.59
CCNDBP1-212ENST00000567690 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
CCNDBP1-212ENST00000567690 RPRMQ9NS64 109 aa5.15□□□□□ -1.59
CCNDBP1-212ENST00000567690 VAX2Q9UIW0 290 aa5.15□□□□□ -1.59
CCNDBP1-212ENST00000567690 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa5.14□□□□□ -1.59
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa5.14□□□□□ -1.59
CCNDBP1-212ENST00000567690 M0R2N4 97 aa5.14□□□□□ -1.59
CCNDBP1-212ENST00000567690 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CCNDBP1-212ENST00000567690 MBP02144 154 aa5.14□□□□□ -1.59
CCNDBP1-212ENST00000567690 AMBPP02760 352 aa5.14□□□□□ -1.59
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