RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561304.5

ZEB1-223, Transcript of zinc finger E-box binding homeobox 1, human

TSL 1 (best)

Gene ZEB1, Length 1,383 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZEB1-223	ENST00000561304		L7N2F9	121 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	INS	P01308	110 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	HBE1	P02100	147 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	HTN3	P15516	51 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	AZU1	P20160	251 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	VAMP2	P63027	116 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	IFITM3	Q01628	133 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	IL15RA	Q13261	267 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	OPCML	Q14982	345 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	PSG3	Q16557	428 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	RRN3P1	Q2M238	152 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	MIC13	Q5XKP0	118 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	ZNF546	Q86UE3	836 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	CCDC32	Q9BV29	185 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	GGACT	Q9BVM4	153 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		5.24	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304		H3BQ15	152 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	GOSR2	O14653	212 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	COX7A2P2	O60397	106 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	IGLC2	P0DOY2	106 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	BCAP31	P51572	246 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	CAV2	P51636	162 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	S100A10	P60903	97 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	ASAH1	Q13510	395 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	RAB32	Q13637	225 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	ZNF846	Q147U1	533 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	FCN2	Q15485	313 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	VWC2	Q2TAL6	325 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	C2orf50	Q96LR7	162 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	SIX6	O95475	246 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	S100A7	P31151	101 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	CAMLG	P49069	296 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	DAD1	P61803	113 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	OXA1L	Q15070	435 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	LCN15	Q6UWW0	184 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	HSPG2	P98160	4391 aa		5.21	□□□□□ -1.57
ZEB1-223	ENST00000561304	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304		A0A1B0GVY2	172 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304		M0R2N4	97 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	RTL8C	O15255	209 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304		P0DMU3	169 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	FAM231A	P0DMU4	169 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	FAM231C	P0DMU5	169 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	CXCL2	P19875	107 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	FGF7	P21781	194 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	SULT1A1	P50225	295 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	B2M	P61769	119 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	RHOB	P62745	196 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	BAX	Q07812	192 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	CT83	Q5H943	113 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304		H0YIZ8	118 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	UPK1B	O75841	260 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	DEFB130B	P0DP73	79 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	DEFB130A	P0DP74	79 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	PYY	P10082	97 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	TSPO	P30536	169 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	CDKN1B	P46527	198 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	NHLH2	Q02577	135 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	S100Z	Q8WXG8	99 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	LINC01587	Q99440	93 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ZEB1-223	ENST00000561304	LYRM9	A8MSI8	78 aa		5.19	□□□□□ -1.58

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