RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 RNF141Q8WVD5 230 aa5.7□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.7□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 PXMP4Q9Y6I8 212 aa5.7□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.7□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa5.69□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 C7orf66A4D0T2 115 aa5.69□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 SNURFLB1AK76 121 aa5.69□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 CDK2AP2O75956 126 aa5.69□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 MBPP02686 304 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 RLN2P04090 185 aa5.69□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 M6PRP20645 277 aa5.69□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 ARL16Q0P5N6 197 aa5.69□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 ZNF846Q147U1 533 aa5.69□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 GUK1Q16774 197 aa5.69□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 C10orf113Q5VZT2 155 aa5.69□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 RXFP4Q8TDU9 374 aa5.69□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 MITD1Q8WV92 249 aa5.69□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 TMEM37Q8WXS4 190 aa5.69□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 ZNF503Q96F45 646 aa5.69□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 A0A0J9YY99 117 aa5.68□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 GAGE12BA1L429 117 aa5.68□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 PRAC2D3DTV9 90 aa5.68□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 H3BQ15 152 aa5.68□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 H3BTX0 84 aa5.68□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 J3KRW8 73 aa5.68□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 GAGE7O76087 117 aa5.68□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 GAGE12FP0CL80 117 aa5.68□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 GAGE12GP0CL81 117 aa5.68□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 GAGE12IP0CL82 117 aa5.68□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 LEPP41159 167 aa5.68□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 CAMLGP49069 296 aa5.68□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 BCAP31P51572 246 aa5.68□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 KIR3DS1Q14943 382 aa5.68□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 OPCMLQ14982 345 aa5.68□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 TTC32Q5I0X7 151 aa5.68□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 GFI1BQ5VTD9 330 aa5.68□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 MGST2Q99735 147 aa5.68□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 C20orf85Q9H1P6 137 aa5.68□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 MUC4Q99102 2169 aa5.67□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 TRAV5A0A0B4J249 113 aa5.67□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa5.67□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 FAM25EA8MYX2 175 aa5.67□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 H3BNG1 76 aa5.67□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 SLC17A3O00476 420 aa5.67□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 CT45A10P0DMU9 189 aa5.67□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 IGLC2P0DOY2 106 aa5.67□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 CAV2P51636 162 aa5.67□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 MORN5Q5VZ52 161 aa5.67□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 NRARPQ7Z6K4 114 aa5.67□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 LINC00612Q8N6U2 182 aa5.67□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa5.67□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 OR1L4Q8NGR5 311 aa5.67□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 PFDN5Q99471 154 aa5.67□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 PYGO2Q9BRQ0 406 aa5.67□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.67□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 TRGV2A0A075B6R0 118 aa5.66□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 A0A1W2PPQ1 181 aa5.66□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 C5orf51A6NDU8 294 aa5.66□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 NPIPB6E9PJ23 425 aa5.66□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 ZNF253O75346 499 aa5.66□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 CST7O76096 145 aa5.66□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 BTF3P20290 206 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 HOXA5P20719 270 aa5.66□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 S100A11P31949 105 aa5.66□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 BTCP35070 178 aa5.66□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 RPL29P47914 159 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 ESRGQ1W209 222 aa5.66□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 MIC13Q5XKP0 118 aa5.66□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 ODF3Q96PU9 254 aa5.66□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 Q9H3A6 140 aa5.66□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 SLC39A9Q9NUM3 307 aa5.66□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 UQCC1Q9NVA1 299 aa5.66□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 DNAH2Q9P225 4427 aa5.65□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 TRBV19A0A075B6N1 114 aa5.65□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 C7orf71A4D174 169 aa5.65□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 FAM24AA6NFZ4 105 aa5.65□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 CCSO14618 274 aa5.65□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 TCRBP04435 133 aa5.65□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 IL7P13232 177 aa5.65□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 SULT1A1P50225 295 aa5.65□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 HBG1P69891 147 aa5.65□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 HBG2P69892 147 aa5.65□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 Q6ZTI0 123 aa5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms