RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554945.1

SRP54-AS1-201, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 600 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-201ENST00000554945 A0A0J9YY99 117 aa6.5□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GAGE12BA1L429 117 aa6.5□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GOSR2O14653 212 aa6.5□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NOL3O60936 208 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GAGE7O76087 117 aa6.5□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GAGE12FP0CL80 117 aa6.5□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GAGE12GP0CL81 117 aa6.5□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GAGE12IP0CL82 117 aa6.5□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HOXA5P20719 270 aa6.5□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KRTAP10-2P60368 255 aa6.5□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C4orf46Q504U0 113 aa6.5□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.5□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.5□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.5□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.5□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C9orf170A2RU37 121 aa6.49□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 H3BMQ9 156 aa6.49□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SSSCA1O60232 199 aa6.49□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CCNKO75909 580 aa6.49□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.49□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TAS2R30P59541 319 aa6.49□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KIR3DS1Q14943 382 aa6.49□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.49□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.49□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF546Q86UE3 836 aa6.49□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.49□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 V9GYH0 126 aa6.49□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PRAC2D3DTV9 90 aa6.48□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 AGPAT2O15120 278 aa6.48□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 COX7A2P2O60397 106 aa6.48□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.48□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ODF3Q96PU9 254 aa6.48□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.48□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GGACTQ9BVM4 153 aa6.48□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.48□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.47□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TSC22D2O75157 780 aa6.47□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 OR4E1P0C645 316 aa6.47□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CT45A10P0DMU9 189 aa6.47□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 S100A5P33763 92 aa6.47□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LEPP41159 167 aa6.47□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GUK1Q16774 197 aa6.47□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.47□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.46□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 A0A096LPF7 62 aa6.46□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.46□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 EPM2AB3EWF7 344 aa6.46□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.46□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 J3KRW8 73 aa6.46□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SLC17A3O00476 420 aa6.46□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 EREGO14944 169 aa6.46□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SIVA1O15304 175 aa6.46□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NDUFB6O95139 128 aa6.46□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SCGB1D2O95969 90 aa6.46□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IGLC2P0DOY2 106 aa6.46□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LINC00315P59091 139 aa6.46□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 OPCMLQ14982 345 aa6.46□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.46□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 Q6ZRG5 221 aa6.46□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 Q6ZTI0 123 aa6.46□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.46□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.46□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C18orf15Q96N68 181 aa6.46□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.46□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.46□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PTTG2Q9NZH5 202 aa6.46□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.45□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 H3BQ15 152 aa6.45□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 H3BTX0 84 aa6.45□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF253O75346 499 aa6.45□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 INPP1P49441 399 aa6.45□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ARL16Q0P5N6 197 aa6.45□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RAB31Q13636 194 aa6.45□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MORN5Q5VZ52 161 aa6.45□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MGST2Q99735 147 aa6.45□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.45□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.45□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GSKIPQ9P0R6 139 aa6.45□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.45□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C7orf66A4D0T2 115 aa6.44□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C7orf71A4D174 169 aa6.44□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CAMLGP49069 296 aa6.44□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ERVFC1-1P60608 527 aa6.44□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.44□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.44□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.44□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.44□□□□□ -1.38
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