RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548588.2

HECTD4-207, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 3

Gene HECTD4, Length 1,030 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-207ENST00000548588 F5H768 121 aa8.39□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 H3BQ15 152 aa8.39□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 IGLC2P0DOY2 106 aa8.39□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 OR1L4Q8NGR5 311 aa8.39□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 C16orf74Q96GX8 76 aa8.39□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.39□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 IGSF23A1L1A6 192 aa8.38□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 H7BYZ3 331 aa8.38□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 ATP5G1P05496 136 aa8.38□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 S100A11P31949 105 aa8.38□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 ATP5G3P48201 142 aa8.38□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 SULT1A1P50225 295 aa8.38□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 BAXQ07812 192 aa8.38□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 RAB32Q13637 225 aa8.38□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 KIR3DS1Q14943 382 aa8.38□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 VWC2Q2TAL6 325 aa8.38□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 Q6ZR54 194 aa8.38□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 STX12Q86Y82 276 aa8.38□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 TMEM252Q8N6L7 170 aa8.38□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 PFDN5Q99471 154 aa8.38□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 ATG101Q9BSB4 218 aa8.38□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 CBY3A6NI87 242 aa8.37□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 NUDT3O95989 172 aa8.37□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 RPL29P47914 159 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 HBG1P69891 147 aa8.37□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 HBG2P69892 147 aa8.37□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 GUK1Q16774 197 aa8.37□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.37□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 MZT2BQ6NZ67 158 aa8.37□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 ZNF493Q6ZR52 646 aa8.37□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.37□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.37□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 J3KRW8 73 aa8.36□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 FGF7P21781 194 aa8.36□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 TNP2Q05952 138 aa8.36□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 IL15RAQ13261 267 aa8.36□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 SOHLH1Q5JUK2 328 aa8.36□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 CCDC28AQ8IWP9 274 aa8.36□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 ZNF586Q9NXT0 402 aa8.36□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.35□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 CT45A10P0DMU9 189 aa8.35□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 LEPP41159 167 aa8.35□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 ATP6V1FQ16864 119 aa8.35□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.35□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 DNAH2Q9P225 4427 aa8.34□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.34□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.34□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.34□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.34□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 ZNF253O75346 499 aa8.34□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 CCL18P55774 89 aa8.34□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 ASAH1Q13510 395 aa8.34□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.34□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 LINC00299Q6ZSB3 139 aa8.34□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 CHAC2Q8WUX2 184 aa8.34□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 RNF141Q8WVD5 230 aa8.34□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 S100ZQ8WXG8 99 aa8.34□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 ODF3Q96PU9 254 aa8.34□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.34□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.34□□□□□ -1.07
HECTD4-207ENST00000548588 SNURFLB1AK76 121 aa8.33□□□□□ -1.08
HECTD4-207ENST00000548588 M0R3E3 92 aa8.33□□□□□ -1.08
HECTD4-207ENST00000548588 MPDU1O75352 247 aa8.33□□□□□ -1.08
HECTD4-207ENST00000548588 SIX6O95475 246 aa8.33□□□□□ -1.08
HECTD4-207ENST00000548588 RLN2P04090 185 aa8.33□□□□□ -1.08
HECTD4-207ENST00000548588 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
HECTD4-207ENST00000548588 ERCC8Q13216 396 aa8.33□□□□□ -1.08
HECTD4-207ENST00000548588 OR5I1Q13606 314 aa8.33□□□□□ -1.08
HECTD4-207ENST00000548588 CLINT1Q14677 625 aa8.33□□□□□ -1.08
HECTD4-207ENST00000548588 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.33□□□□□ -1.08
HECTD4-207ENST00000548588 THAP6Q8TBB0 222 aa8.33□□□□□ -1.08
HECTD4-207ENST00000548588 ENKURQ8TC29 256 aa8.33□□□□□ -1.08
HECTD4-207ENST00000548588 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
HECTD4-207ENST00000548588 NPCDR1Q9BY65 106 aa8.33□□□□□ -1.08
HECTD4-207ENST00000548588 GAGE12BA1L429 117 aa8.32□□□□□ -1.08
HECTD4-207ENST00000548588 GAGE7O76087 117 aa8.32□□□□□ -1.08
HECTD4-207ENST00000548588 NDUFB4O95168 129 aa8.32□□□□□ -1.08
HECTD4-207ENST00000548588 GAGE12FP0CL80 117 aa8.32□□□□□ -1.08
HECTD4-207ENST00000548588 GAGE12GP0CL81 117 aa8.32□□□□□ -1.08
HECTD4-207ENST00000548588 GAGE12IP0CL82 117 aa8.32□□□□□ -1.08
HECTD4-207ENST00000548588 PYYP10082 97 aa8.32□□□□□ -1.08
HECTD4-207ENST00000548588 NHLH2Q02577 135 aa8.32□□□□□ -1.08
HECTD4-207ENST00000548588 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa8.32□□□□□ -1.08
HECTD4-207ENST00000548588 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.32□□□□□ -1.08
HECTD4-207ENST00000548588 OR5C1Q8NGR4 320 aa8.32□□□□□ -1.08
HECTD4-207ENST00000548588 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.32□□□□□ -1.08
HECTD4-207ENST00000548588 BLNKQ8WV28 456 aa8.32□□□□□ -1.08
HECTD4-207ENST00000548588 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.32□□□□□ -1.08
HECTD4-207ENST00000548588 PRELID1Q9Y255 219 aa8.32□□□□□ -1.08
HECTD4-207ENST00000548588 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.32□□□□□ -1.08
HECTD4-207ENST00000548588 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms