RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	C6orf223	Q8N319	242 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	RNF141	Q8WVD5	230 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	NMES1	Q9C002	83 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	MED28	Q9H204	178 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	IGSF23	A1L1A6	192 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	CXCL2	P19875	107 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	TAS2R30	P59541	319 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	LCN15	Q6UWW0	184 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777		H7BYZ3	331 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	AGPAT2	O15120	278 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	TSC22D2	O75157	780 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	CLINT1	Q14677	625 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777		Q5BKY6	102 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF546	Q86UE3	836 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DDX11-222	ENST00000542777	C16orf90	A8MZG2	172 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777		L7N2F9	121 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	VAMP2	P63027	116 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	KIR3DS1	Q14943	382 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777		Q6ZNX1	250 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	SSX7	Q7RTT5	188 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	GGACT	Q9BVM4	153 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	PRAC2	D3DTV9	90 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777		H3BTX0	84 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	COX7A2P2	O60397	106 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	CST7	O76096	145 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	MPC2	O95563	127 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	OR5I1	Q13606	314 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777		G3V3Q6	166 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	BCAP31	P51572	246 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	CAV2	P51636	162 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	MORN5	Q5VZ52	161 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	MGST2	Q99735	147 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777		Q9H8V8	135 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	MBD2	Q9UBB5	411 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	SLC17A3	O00476	420 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	OPCML	Q14982	345 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777		A0A0J9YY99	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777		A0A1B0GVG6	124 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	GAGE12B	A1L429	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	SNURFL	B1AK76	121 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777		H3BQ15	152 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	SMLR1	H3BR10	107 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777		J3KRW8	73 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	CDK2AP2	O75956	126 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	GAGE7	O76087	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	RLN2	P04090	185 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	GAGE12F	P0CL80	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	GAGE12G	P0CL81	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	GAGE12I	P0CL82	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	IGLC2	P0DOY2	106 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	M6PR	P20645	277 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	NHLH2	Q02577	135 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		11.16	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	HSPG2	P98160	4391 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	CT45A10	P0DMU9	189 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	HOXA5	P20719	270 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	CAMLG	P49069	296 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	RAB31	Q13636	194 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777		Q6ZRG5	221 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF503	Q96F45	646 aa		11.15	□□□□□ -0.62
DDX11-222	ENST00000542777	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDX11-222	ENST00000542777		E5RGE8	158 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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