RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 Q86TA4 180 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 TNFRSF14Q92956 283 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 GAFA1Q96PS6 74 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 BAHCC1Q9P281 2608 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 A0A0G2JLM5 398 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 GP9P14770 177 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 ERHP84090 104 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 OR10AG1Q8NH19 301 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 CACNG8Q8WXS5 425 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 ADTRPQ96IZ2 230 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 C18orf15Q96N68 181 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 INSIG2Q9Y5U4 225 aa7.23□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 A0A1W2PPI3 338 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 IGLV2-11P01706 119 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 CACNG7P62955 275 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 FAM162BQ5T6X4 162 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 PERPQ96FX8 193 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 ACANP16112 2415 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 TMEM178BH3BS89 294 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 GNG7O60262 68 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 SEC11AP67812 179 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 ZNF492Q9P255 531 aa7.22□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 A6NJY4 79 aa7.21□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.21□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 H3BRM9 83 aa7.21□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 LGALS7P47929 136 aa7.21□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 CT83Q5H943 113 aa7.21□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 THAP8Q8NA92 274 aa7.21□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 OR2K2Q8NGT1 345 aa7.21□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 C17orf77Q96MU5 243 aa7.21□□□□□ -1.25
THBS3-211ENST00000541990 PPIAL4EA0A075B759 164 aa7.21□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa7.21□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 K7ERJ3 54 aa7.21□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 HAX1O00165 279 aa7.21□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 PPIAL4FP0DN26 164 aa7.21□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 PPIAL4GP0DN37 164 aa7.21□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 BMI1P35226 326 aa7.21□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa7.21□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa7.21□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.21□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 FMC1Q96HJ9 113 aa7.21□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 AP1S3Q96PC3 154 aa7.21□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa7.21□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.21□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa7.21□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 SLC25A17O43808 307 aa7.21□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 TNFRSF1AP19438 455 aa7.21□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 NMUP48645 174 aa7.21□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.21□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 FA2HQ7L5A8 372 aa7.21□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 S100A7AQ86SG5 101 aa7.21□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.21□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 TMEM213A2RRL7 107 aa7.2□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 SMKR1H3BMG3 65 aa7.2□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.2□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa7.2□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.2□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 ITPR2Q14571 2701 aa7.2□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 A0A1B0GUT8 65 aa7.2□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.2□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 D6R8Y8 96 aa7.2□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 IGLV2-23P01705 113 aa7.2□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 CRIP1P50238 77 aa7.2□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 TMEM186Q96B77 213 aa7.2□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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THBS3-211ENST00000541990 B9A039 149 aa7.19□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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THBS3-211ENST00000541990 ZNF788Q6ZQV5 615 aa7.19□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 AMN1Q8IY45 258 aa7.19□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 OR5AN1Q8NGI8 311 aa7.19□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.19□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa7.19□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 DKK2Q9UBU2 259 aa7.19□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa7.19□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 CNTFRP26992 372 aa7.19□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 GATA4P43694 442 aa7.19□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 FXYD2P54710 66 aa7.19□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 LYZP61626 148 aa7.19□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa7.19□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 VSTM5A8MXK1 200 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-211ENST00000541990 KRTAP10-9P60411 292 aa7.18□□□□□ -1.26
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