RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 GGTLC3B5MD39 225 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 FHL1Q13642 323 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 RASL11AQ6T310 242 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 DERL1Q9BUN8 251 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 A0A0G2JRQ6 117 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 APRG1Q8IVJ8 170 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM243Q9BU79 118 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 LEPROTO15243 131 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 SERF1AO75920 110 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 SMKR1H3BMG3 65 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 PFN1P07737 140 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 FOXI2Q6ZQN5 318 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 HELZP42694 1942 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM238C9JI98 176 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 C15orf65H3BRN8 121 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 I3L3M4 83 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 Q9HAA7 133 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 H3BRN7 92 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 SLAQ13239 276 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 TTC32Q5I0X7 151 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 TYMSP04818 313 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF134P52741 427 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 CCL18P55774 89 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 OR11H6Q8NGC7 330 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 SPXQ9BT56 116 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 ARTNQ5T4W7 220 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 SFTA2Q6UW10 78 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 PTPRDP23468 1912 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 INAFM1C9JVW0 142 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 IGKV1-39P01597 117 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 IGKV1D-39P04432 117 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 NUP35Q8NFH5 326 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 LY6G5BQ8NDX9 201 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF524Q96C55 264 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 ATP6V0BQ99437 205 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 SMPXQ9UHP9 88 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 MYCNOSP40205 109 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 PRO3102Q9H379 93 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 Q8NA96 180 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM170AQ8WVE7 144 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 Q6ZQT7 251 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 C19orf84I3L1E1 186 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 UBE2BP63146 152 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 CTAG1AP78358 180 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 Q6ZRM9 215 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 BLCAPP62952 87 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 PMVKQ15126 192 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 RHOHQ15669 191 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 C8orf31Q8N9H6 132 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 IL17DQ8TAD2 202 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 BRWD1Q9NSI6 2320 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 AMN1Q8IY45 258 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 Q8NFD4 153 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM126AQ9H061 195 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 A0A087WW49 117 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 C16orf74Q96GX8 76 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 A0A1B0GWB2 263 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 LINC01559Q495D7 138 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 RP1P56715 2156 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 VWC2LB2RUY7 222 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 CD5LO43866 347 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 ANAPC10Q9UM13 185 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-204ENST00000538708 MYLKQ15746 1914 aa7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms