RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537568.1

LMO3-216, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 594 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-216ENST00000537568 MORN2Q502X0 79 aa6.22□□□□□ -1.41
LMO3-216ENST00000537568 C2orf83Q53S99 150 aa6.22□□□□□ -1.41
LMO3-216ENST00000537568 PSMG4Q5JS54 123 aa6.22□□□□□ -1.41
LMO3-216ENST00000537568 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
LMO3-216ENST00000537568 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.22□□□□□ -1.41
LMO3-216ENST00000537568 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.22□□□□□ -1.41
LMO3-216ENST00000537568 OR4A5Q8NH83 315 aa6.22□□□□□ -1.41
LMO3-216ENST00000537568 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
LMO3-216ENST00000537568 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
LMO3-216ENST00000537568 BORCS7Q96B45 105 aa6.22□□□□□ -1.41
LMO3-216ENST00000537568 TPPP3Q9BW30 176 aa6.22□□□□□ -1.41
LMO3-216ENST00000537568 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
LMO3-216ENST00000537568 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
LMO3-216ENST00000537568 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
LMO3-216ENST00000537568 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 A0A1W2PPI3 338 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 SNURFLB1AK76 121 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 SRRM5B3KS81 715 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 LYNX1G3V0Z9 82 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 J3QLI3 93 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 OR2J3O76001 311 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 OR5AL1P0C617 328 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 LYNX1P0DP58 116 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 CCL2P13500 99 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 WDR82Q6UXN9 313 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 LRP11Q86VZ4 500 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 SLC25A40Q8TBP6 338 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 ZNF714Q96N38 554 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 BET1LQ9NYM9 111 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 GNG12Q9UBI6 72 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 PSG11Q9UQ72 335 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 MUC4Q99102 2169 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 A0A1W2PN81 502 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 NDUFA7O95182 113 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 IGLV1-44P01699 117 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 OR9G9P0C7N8 305 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 C8orf88P0DMB2 117 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 CGB3P0DN86 165 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 CGB7P0DN87 165 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 IGLC2P0DOY2 106 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 IGLC3P0DOY3 106 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 PRDX2P32119 198 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 MPV17P39210 176 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 UBE2G2P60604 165 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 LMO4P61968 165 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 PRCDQ00LT1 54 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 AESQ08117 197 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 VSTM2AQ8TAG5 236 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 NRN1Q9NPD7 142 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 HSPG2P98160 4391 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 A0A1B0GW15 77 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 K7EP13 123 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 M0R1X1 148 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 TOMM40O96008 361 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 CRYAAP02489 173 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 APCSP02743 223 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 CBLN1P23435 193 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 PAX2Q02962 417 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 PRSS8Q16651 343 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 CENPWQ5EE01 88 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 C9orf135Q5VTT2 229 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 MIC13Q5XKP0 118 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 STUMQ69YW2 141 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 ZNF738Q8NE65 137 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 OR13A1Q8NGR1 328 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 MRGPRDQ8TDS7 321 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 NABP2Q9BQ15 211 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 DERL1Q9BUN8 251 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 GNB4Q9HAV0 340 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 ST20Q9HBF5 79 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-216ENST00000537568 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.3 ms