RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529454.5

RPS6KA1-215, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A1, human

TSL 5

Gene RPS6KA1, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	SRR	Q9GZT4	340 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	PKD1	P98161	4303 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	FAM25E	A8MYX2	175 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	SLC17A3	O00476	420 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	CAV2	P51636	162 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	OPCML	Q14982	345 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	MGST2	Q99735	147 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454		Q9H3A6	140 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454		A0A1W2PPQ1	181 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	C7orf66	A4D0T2	115 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	PRAC2	D3DTV9	90 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454		H3BNG1	76 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KIR3DS1	Q14943	382 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	ODF3	Q96PU9	254 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	PFDN5	Q99471	154 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	IGLC2	P0DOY2	106 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	HOXA5	P20719	270 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	BAK1	Q16611	211 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	MITD1	Q8WV92	249 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	UPK3B	Q9BT76	320 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RPS6KA1-215	ENST00000529454	C5orf51	A6NDU8	294 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454		H3BQ15	152 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	CT45A10	P0DMU9	189 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	BAX	Q07812	192 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	ARL16	Q0P5N6	197 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	ESRG	Q1W209	222 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	MORN5	Q5VZ52	161 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	MIC13	Q5XKP0	118 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	C7orf71	A4D174	169 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	CCS	O14618	274 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	EREG	O14944	169 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	CST7	O76096	145 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454		Q6ZTI0	123 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454		Q8N1X5	172 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	RYR1	P21817	5038 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	ZNF253	O75346	499 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	S100A10	P60903	97 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	STX12	Q86Y82	276 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	FUT9	Q9Y231	359 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	PRELID1	Q9Y255	219 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	HBG1	P69891	147 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	HBG2	P69892	147 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	RGS13	O14921	159 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	SIVA1	O15304	175 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	GPX1	P07203	203 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	IL7	P13232	177 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	S100A11	P31949	105 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	ERCC8	Q13216	396 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	BLNK	Q8WV28	456 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	LINC00477	Q96M19	166 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454		A0A096LPF7	62 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454		M0R3E3	92 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPS6KA1-215	ENST00000529454	PAX4	O43316	350 aa		10.03	□□□□□ -0.8

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