RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528140.5

MYB-223, Transcript of MYB proto-oncogene, transcription factor, human

TSL 1 (best)

Gene MYB, Length 2,021 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYB-223	ENST00000528140	VSIR	Q9H7M9	311 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	C12orf77	C9JDV5	145 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140		F2Z2F3	143 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	HLA-DQA1	P01909	254 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	HBZ	P02008	142 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	SERPINE2	P07093	398 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	SLC25A6	P12236	298 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	NTF3	P20783	257 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	FXYD4	P59646	89 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	HERV-K104	P63124	156 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	LINC00311	Q8N616	119 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140		A0A1B0GW15	77 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	PAGE4	O60829	102 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	HSBP1	O75506	76 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	TMEM50A	O95807	157 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	FABP2	P12104	132 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	GAGE5	Q13069	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	GAGE6	Q13070	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	NMS	Q5H8A3	153 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	LCN12	Q6JVE5	192 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140		Q6ZPA2	131 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	GAPT	Q8N292	157 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	OR4A5	Q8NH83	315 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	OR1L1	Q8NH94	360 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	BLNK	Q8WV28	456 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140		A0A0G2JLM5	398 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	OR4C46	A6NHA9	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140		M0R2Z0	102 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	PDCD6	O75340	191 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	MOS	P00540	346 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	IGHG2	P01859	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	ZNF134	P52741	427 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	SLC35B1	P78383	322 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	EBI3	Q14213	229 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140		Q8N6K4	173 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	MRAP	Q8TCY5	172 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	GALM	Q96C23	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	CYYR1	Q96J86	154 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	GPR82	Q96P67	336 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140		A0A1W2PPM0	123 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	NDUFB4	O95168	129 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	APOA2	P02652	100 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	SRI	P30626	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	GPR12	P47775	334 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	ZNF137P	P52743	207 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	PAX9	P55771	341 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	CX3CL1	P78423	397 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140		Q8N9W7	124 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	C5orf30	Q96GV9	206 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	RCHY1	Q96PM5	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MYB-223	ENST00000528140	HINT2	Q9BX68	163 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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