RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa6.74□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 OVOL3O00110 214 aa6.74□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 FAM106CPP0CH98 169 aa6.74□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 ASIPP42127 132 aa6.74□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 LY6DQ14210 128 aa6.74□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.74□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.74□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM158Q8WZ71 300 aa6.74□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.74□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.74□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 FBXL15Q9H469 300 aa6.74□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 ZMAT4Q9H898 229 aa6.74□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 NGBQ9NPG2 151 aa6.74□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 DSCAMO60469 2012 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 MOSP00540 346 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 PRDX2P32119 198 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 PAX8Q06710 450 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 GATD1Q8NB37 220 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 NABP2Q9BQ15 211 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 FAM234AQ9H0X4 552 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 PEX7O00628 323 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 SPRY3O43610 288 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 MOB3BQ86TA1 216 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 LINC01587Q99440 93 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 MLST8Q9BVC4 326 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 LINC01548A6NM66 108 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 SRRM5B3KS81 715 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 SNCGO76070 127 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 IGHV3-13P01766 116 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 TNFRSF1AP19438 455 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 FAM27E3Q08E93 113 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 DKK2Q9UBU2 259 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 LINC00473A8K010 186 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 SPINT2O43291 252 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 CRLF1O75462 422 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 COL8A1P27658 744 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 MZT1Q08AG7 82 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 FAM201AQ5SY85 155 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 DLL1O00548 723 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 TGFAP01135 160 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 GLRXP35754 106 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF492Q9P255 531 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 GNG12Q9UBI6 72 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
TRPS1-209ENST00000519674 C15orf65H3BRN8 121 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF329Q86UD4 541 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 ITLN1Q8WWA0 313 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 TPPP3Q9BW30 176 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 HBDP02042 147 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 C8orf88P0DMB2 117 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 DUTP33316 252 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 POU2AF1Q16633 256 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 RELNP78509 3460 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 LINC00694P0DN24 101 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 FAM57AQ8TBR7 257 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 DSCAML1Q8TD84 2053 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 A0A1W2PPI3 338 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 LINC01619G3V211 115 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 P01737 135 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 NBL1P41271 181 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 KIR2DS2P43631 304 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 UBE2D3P61077 147 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 UBE2D2P62837 147 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 SLC25A2Q9BXI2 301 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 SPTA1P02549 2419 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 FCGR3BO75015 233 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 PROP1O75360 226 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 MYCNOSP40205 109 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 RPL39P5Q59GN2 51 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 UTF1Q5T230 341 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 Q6ZQT7 251 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-209ENST00000519674 DEFB108BQ8NET1 73 aa6.69□□□□□ -1.34
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