RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519494.1

TGS1-202, Transcript of trimethylguanosine synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TGS1, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1-202ENST00000519494 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
TGS1-202ENST00000519494 NCAPD3P42695 1498 aa0.1□□□□□ -2.39
TGS1-202ENST00000519494 OTOGQ6ZRI0 2925 aa0.09□□□□□ -2.39
TGS1-202ENST00000519494 NUPR2A6NF83 97 aa0.09□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 RIIAD1A6NNX1 92 aa0.09□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 AIPO00170 330 aa0.09□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 HIST1H2BKO60814 126 aa0.09□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 IFNA1P01562 189 aa0.09□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 HIST1H2BJP06899 126 aa0.09□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 OGNP20774 298 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 FXYD4P59646 89 aa0.09□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 GNG3P63215 75 aa0.09□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 TMED2Q15363 201 aa0.09□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 SPATA45Q537H7 98 aa0.09□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 C1orf140Q5VVS0 124 aa0.09□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 FOXI2Q6ZQN5 318 aa0.09□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 LINC00269Q8N2A0 174 aa0.09□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 LRRC18Q8N456 261 aa0.09□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 SMIM20Q8N5G0 67 aa0.09□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 CEP19Q96LK0 163 aa0.09□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 LIMD2Q9BT23 127 aa0.09□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 KCPQ6ZWJ8 1503 aa0.08□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 TRAV5A0A0B4J249 113 aa0.08□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 IGHV3-33P01772 117 aa0.08□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 HBBP68871 147 aa0.08□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 LTC4SQ16873 150 aa0.08□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa0.08□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 FKBP1CQ5VVH2 108 aa0.08□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa0.08□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 LYG2Q86SG7 212 aa0.08□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 ATOH7Q8N100 152 aa0.08□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 NUP35Q8NFH5 326 aa0.08□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP0.08□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 OTORQ9NRC9 128 aa0.08□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 SSR3Q9UNL2 185 aa0.08□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa0.08□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 A0A0J9YY99 117 aa0.07□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 ZNF727A8MUV8 499 aa0.07□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 CST7O76096 145 aa0.07□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 IFNA14P01570 189 aa0.07□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 GLRXP35754 106 aa0.07□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 TAS2R41P59536 307 aa0.07□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 OCIAD2Q56VL3 154 aa0.07□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 FAM216BQ8N7L0 139 aa0.07□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 OR13C6PQ8NH95 151 aa0.07□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 CCL4L1Q8NHW4 92 aa0.07□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 PLAC4Q8WY50 150 aa0.07□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 AP3S1Q92572 193 aa0.07□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 PLEKHB2Q96CS7 222 aa0.07□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 MALSU1Q96EH3 234 aa0.07□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 RTL8AQ9BWD3 113 aa0.07□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 PLAC8Q9NZF1 115 aa0.07□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 UFC1Q9Y3C8 167 aa0.07□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 ESPL1Q14674 2120 aa0.07□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 RTL9Q8NET4 1388 aa0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 TECPR2O15040 1411 aa0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 TMEM238C9JI98 176 aa0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 H7BYZ3 331 aa0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 APOA2P02652 100 aa0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 IFNA4P05014 189 aa0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 PDE6GP18545 87 aa0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 RPL35P42766 123 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 SPINT3P49223 89 aa0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 ZNF137PP52743 207 aa0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 SPINK7P58062 85 aa0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 VBP1P61758 197 aa0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 RPL19P84098 196 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 POU6F1Q14863 301 aa0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 RTL8BQ17RB0 113 aa0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 Q86TA4 180 aa0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 PRR15Q8IV56 129 aa0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 IFT20Q8IY31 132 aa0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 CDC26Q8NHZ8 85 aa0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 DIRC1Q969H9 104 aa0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 CCL19Q99731 98 aa0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 PBDC1Q9BVG4 233 aa0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 OR2H1Q9GZK4 316 aa0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 CST11Q9H112 138 aa0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 LRTM1Q9HBL6 345 aa0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 IL20Q9NYY1 176 aa0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 HSPB8Q9UJY1 196 aa0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 IGSF10Q6WRI0 2623 aa0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 ANK2Q01484 3957 aa0.05□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 A0A096LPI6 279 aa0.05□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 GPR31O00270 319 aa0.05□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 LYRM1O43325 122 aa0.05□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 CCL4P13236 92 aa0.05□□□□□ -2.4
TGS1-202ENST00000519494 PPP1R2P41236 205 aa0.05□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms