RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 SEC61GP60059 68 aa6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 CD69Q07108 199 aa6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 LCN12Q6JVE5 192 aa6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC179H3BU77 68 aa6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 PRB1P04280 392 aa6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 FXYD3Q14802 87 aa6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 RPEL1Q2QD12 228 aa6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 Q56UQ5 140 aa6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 GNB4Q9HAV0 340 aa6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-208ENST00000519076 PMS2P5A8MQ11 134 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 GCHFRP30047 84 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 EFNA4P52798 201 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 RITA1Q96K30 269 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 CCL19Q99731 98 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 VGLL1Q99990 258 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 DSCAML1Q8TD84 2053 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 A0A087X0K7 114 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1W2PPI3 338 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 H3BTX0 84 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 WT1-ASQ06250 92 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 SLC25A33Q9BSK2 321 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 PRORYQ9H606 182 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM8BA6NDV4 472 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 E7EUB6 86 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 F2Z2F3 143 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 EVI2AP22794 236 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 ECSCRQ19T08 205 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 Q6AWC8 147 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 CDIP1Q9H305 208 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 FCN1O00602 326 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 SPINK4O60575 86 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 FCN3O75636 299 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF90Q03938 601 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 C2orf83Q53S99 150 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF841Q6ZN19 808 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 C19orf84I3L1E1 186 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 C8orf88P0DMB2 117 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 CBLN1P23435 193 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 UBE2G1P62253 170 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 KIR3DS1Q14943 382 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00311Q8N616 119 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 TEX45Q8NA69 505 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 SYT8Q8NBV8 401 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 FAM168AQ92567 244 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 SGK494Q96LW2 274 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 NBR2O15453 112 aa6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 PAXXQ9BUH6 204 aa6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 C1RLQ9NZP8 487 aa6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 FLNCQ14315 2725 aa6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 FNDC10F2Z333 226 aa6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 FAM106CPP0CH98 169 aa6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 WFDC2Q14508 124 aa6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 ETDBQ3ZM63 59 aa6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 FASNP49327 2511 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 OR4C46A6NHA9 309 aa6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 XGP55808 180 aa6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 C20orf78Q9BR46 151 aa6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.24□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV3-23P01764 117 aa6.24□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 PYYP10082 97 aa6.24□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.24□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 TTC32Q5I0X7 151 aa6.24□□□□□ -1.41
TRPS1-208ENST00000519076 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.24□□□□□ -1.41
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