RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511105.1

PTPN13-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13, human

TSL 3

Gene PTPN13, Length 645 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN13-208	ENST00000511105	FXYD7	P58549	80 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	OR2F1	Q13607	317 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	DEFB135	Q30KP9	77 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	TCF24	Q7RTU0	167 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	OR1P1	Q8NH06	330 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	ACY3	Q96HD9	319 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	HIST1H4G	Q99525	98 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	NAA60	Q9H7X0	242 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	SMPX	Q9UHP9	88 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	RABAC1	Q9UI14	185 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	COL7A1	Q02388	2944 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105		A0A0J9YWU9	116 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	C3orf84	H3BNL1	204 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	NDUFA4	O00483	81 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	CDS2	O95674	445 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	IFNA10	P01566	189 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	MB	P02144	154 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105		P0C879	139 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	RND2	P52198	227 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	DEFB131A	P59861	70 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	SLA	Q13239	276 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	ASAH1	Q13510	395 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	KLK9	Q2XQG4	91 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	OR1S1	Q8NH92	325 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	GTSF1	Q8WW33	167 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	BORCS5	Q969J3	196 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	TSC22D3	Q99576	134 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	SOST	Q9BQB4	213 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105		V9GYH0	126 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	FAM231B	A6NCW3	169 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105		A8MWP6	167 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105		H3BP45	60 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	CYB5B	O43169	146 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	ADAP1	O75689	374 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	CCNK	O75909	580 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	IFNA4	P05014	189 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	ZNF688	P0C7X2	276 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	NPPC	P23582	126 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	S100A5	P33763	92 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	SPCS3	P61009	180 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	ZNF90	Q03938	601 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	PPP1R1A	Q13522	171 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	ZNF79	Q15937	498 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	C6orf223	Q8N319	242 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	LINC00052	Q96N35	136 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	KIR2DL4	Q99706	377 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	TENM2	Q9NT68	2774 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105		K7EMT4	169 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	ATG12	O94817	140 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	SFT2D2	O95562	160 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	IGKV1-17	P01599	117 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PTPN13-208	ENST00000511105	PRM2	P04554	102 aa		3.34	□□□□□ -1.87

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