RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 OR10J4P0C629 311 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 STAG3L2P0CL84 134 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 STAG3L3P0CL85 134 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 MIFP14174 115 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 DPPA3Q6W0C5 159 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 BAP18Q8IXM2 172 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 OR11H2Q8NH07 326 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 CMTM2Q8TAZ6 248 aa10.65□□□□□ -0.7
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SH3BP2-208ENST00000504294 CYTL1Q9NRR1 136 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa10.64□□□□□ -0.71
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SH3BP2-208ENST00000504294 IGKV3-20P01619 116 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 ICAM4Q14773 271 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 ZFP69Q49AA0 526 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 GDF5OSQ5U4N7 250 aa10.64□□□□□ -0.71
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SH3BP2-208ENST00000504294 ODF3Q96PU9 254 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 SH3BGRL3Q9H299 93 aa10.64□□□□□ -0.71
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SH3BP2-208ENST00000504294 RBAKDNA6NC62 111 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 F6UB75 175 aa10.63□□□□□ -0.71
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SH3BP2-208ENST00000504294 NDUFB4O95168 129 aa10.63□□□□□ -0.71
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SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM256Q8N2U0 113 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 NEU1Q99519 415 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 C20orf144Q9BQM9 153 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 OTORQ9NRC9 128 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 XCL2Q9UBD3 114 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 RFNGQ9Y644 331 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM189A5PLL7 270 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 C3orf84H3BNL1 204 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 H3BTX0 84 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 INSP01308 110 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
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SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM78Q5T7P6 136 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC51BQ86UW2 128 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM208Q9BTX3 173 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 Q9H3A6 140 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 RETNQ9HD89 108 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 TEX46H3BTG2 121 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 K7EQM0 130 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 NMBP08949 121 aa10.61□□□□□ -0.71
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SH3BP2-208ENST00000504294 HLA-DMBP28068 263 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 SUN5Q8TC36 379 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
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SH3BP2-208ENST00000504294 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 PGPA6NDG6 321 aa10.6□□□□□ -0.71
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SH3BP2-208ENST00000504294 NPIPB6E9PJ23 425 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 GCHFRP30047 84 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 PPT1P50897 306 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 AMTNQ6UX39 209 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF503Q96F45 646 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 HBE1P02100 147 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
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SH3BP2-208ENST00000504294 MUC7Q8TAX7 377 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 TMED6Q8WW62 240 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 PHYHIPLQ96FC7 376 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC35B3Q9H1N7 401 aa10.59□□□□□ -0.71
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SH3BP2-208ENST00000504294 A0A1W2PRE2 83 aa10.58□□□□□ -0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 M0R3E3 92 aa10.58□□□□□ -0.72
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SH3BP2-208ENST00000504294 SPINK13Q1W4C9 94 aa10.58□□□□□ -0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 TCEAL7Q9BRU2 100 aa10.58□□□□□ -0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa10.58□□□□□ -0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa10.57□□□□□ -0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 F6UZH7 168 aa10.57□□□□□ -0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 FXYD7P58549 80 aa10.57□□□□□ -0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 RRN3P1Q2M238 152 aa10.57□□□□□ -0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 C5orf17Q8NAS9 161 aa10.57□□□□□ -0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa10.57□□□□□ -0.72
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SH3BP2-208ENST00000504294 DIRC3C9JPN6 131 aa10.56□□□□□ -0.72
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