RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 PPBPP02775 128 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 CLPSP04118 112 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 IL4P05112 153 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 SERPINA7P05543 415 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 CST2P09228 141 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 CTLA4P16410 223 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 HTR1DP28221 377 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 CMPK1P30085 196 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 OR10J1P30954 320 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 DNASE1L1P49184 302 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 EMP2P54851 167 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 TAS2R30P59541 319 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 RPS20P60866 119 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 S100A10P60903 97 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 LCN6P62502 163 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF616Q08AN1 781 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 TAF9Q16594 264 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 PRSS8Q16651 343 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 ASCL4Q6XD76 172 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 MARCH3Q86UD3 253 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 FRAS1Q86XX4 4008 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 CA13Q8N1Q1 262 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF321PQ8N8H1 164 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF709Q8N972 641 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 SLC26A10Q8NG04 563 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 OR52R1Q8NGF1 315 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 OR10W1Q8NGF6 305 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 OR5H2Q8NGV7 314 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 FAM213BQ8TBF2 198 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 FAM57AQ8TBR7 257 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 DOK4Q8TEW6 326 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 RNF133Q8WVZ7 376 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 DDIT4LQ96D03 193 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 FAAP24Q9BTP7 215 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 PECRQ9BY49 303 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 TXNIPQ9H3M7 391 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 NAA60Q9H7X0 242 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 FAM60AQ9NP50 221 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 CBLN4Q9NTU7 201 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 SCN3AQ9NY46 2000 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 GSKIPQ9P0R6 139 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 NAGKQ9UJ70 344 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa2.55□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 STARD9Q9P2P6 4700 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 IGSF23A1L1A6 192 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 LRCOL1A6NCL2 159 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 OR6C6A6NF89 314 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 FAM24AA6NFZ4 105 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 H3BSH0 61 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 PLPP3O14495 311 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 RTL8CO15255 209 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 CCL25O15444 150 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 CDS2O95674 445 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 CSTAP01040 98 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 PRH1P02810 166 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 REG1AP05451 166 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 BCL2P10415 239 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 MSR1P21757 451 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 SRP14P37108 136 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 MYCNOSP40205 109 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 KRTAP10-8P60410 259 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 RANP62826 216 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 LCN2P80188 198 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 DEFB110Q30KQ9 67 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 MORN2Q502X0 79 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 LYZL2Q7Z4W2 148 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM144Q7Z5S9 345 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF645Q8N7E2 425 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 OR5D14Q8NGL3 314 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 NEK7Q8TDX7 302 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 C22orf15Q8WYQ4 148 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM56Q96MV1 263 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 RNF5Q99942 180 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 OR2J1Q9GZK6 312 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 C8orf17Q9NRJ1 99 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM106BQ9NUM4 274 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 FKBP11Q9NYL4 201 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 NAT8Q9UHE5 227 aa2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
POLR1B-215ENST00000498054 FAM215AQ9Y5M1 114 aa2.54□□□□□ -2
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