RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496887.6

KCNQ1-205, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-205ENST00000496887 FUT9Q9Y231 359 aa12.13□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 NDUFB4O95168 129 aa12.12□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 GIPP09681 153 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 OXA1LQ15070 435 aa12.12□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 Q5BKY6 102 aa12.12□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 Q6ZTC4 211 aa12.12□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF767PQ75MW2 155 aa12.12□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 OR10J6PQ8NGY7 276 aa12.12□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 TIMM9Q9Y5J7 89 aa12.12□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 TMEM189A5PLL7 270 aa12.11□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 HBE1P02100 147 aa12.11□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 RRN3P1Q2M238 152 aa12.11□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 C12orf74Q32Q52 190 aa12.11□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 ASB13Q8WXK3 278 aa12.11□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 OR51M1Q9H341 326 aa12.11□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 C11orf94C9JXX5 98 aa12.1□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 M0R3E3 92 aa12.1□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 PRM2P04554 102 aa12.1□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 NBEAP1P0C6P0 100 aa12.1□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 PDE6HQ13956 83 aa12.1□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa12.1□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 C2CD4CQ8TF44 421 aa12.1□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 AQP10Q96PS8 301 aa12.1□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 PAXXQ9BUH6 204 aa12.1□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa12.09□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 OR10J4P0C629 311 aa12.09□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 SPART-AS1P0CW21 52 aa12.09□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 CDKN1BP46527 198 aa12.09□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 RNF141Q8WVD5 230 aa12.09□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 LINC00476Q8WZB0 136 aa12.09□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 FXYD5Q96DB9 178 aa12.09□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 PRELID1Q9Y255 219 aa12.09□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 TRAV10A0A0B4J240 114 aa12.08□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 OR7C2O60412 319 aa12.08□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 LY6G6CO95867 125 aa12.08□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 CT45A10P0DMU9 189 aa12.08□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 LINC01587Q99440 93 aa12.08□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 AAMDCQ9H7C9 122 aa12.08□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 DKK2Q9UBU2 259 aa12.08□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 IGLL5B9A064 214 aa12.07□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 NPIPB6E9PJ23 425 aa12.07□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 ICAM4Q14773 271 aa12.07□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 KIR3DS1Q14943 382 aa12.07□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM222AQ5U5X8 452 aa12.07□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 OR2T35Q8NGX2 323 aa12.07□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF503Q96F45 646 aa12.07□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 VPS13DQ5THJ4 4388 aa12.07□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP12.06□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 AZU1P20160 251 aa12.06□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 TSPOP30536 169 aa12.06□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 ERCC8Q13216 396 aa12.06□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF266Q14584 549 aa12.06□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM122CQ6P4D5 195 aa12.06□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 TMEM256Q8N2U0 113 aa12.06□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 PHYHIPLQ96FC7 376 aa12.06□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa12.06□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa12.05□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa12.05□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 J3KRW8 73 aa12.05□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 M6PRP20645 277 aa12.05□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 TAS2R45P59539 299 aa12.05□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 RAB2AP61019 212 aa12.05□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 KHDC3LQ587J8 217 aa12.05□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 GFI1BQ5VTD9 330 aa12.05□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa12.05□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 ODF3Q96PU9 254 aa12.05□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa12.05□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa12.04□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 HTN1P15515 57 aa12.04□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 LEPP41159 167 aa12.04□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 TAS2R60P59551 318 aa12.04□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 RANP62826 216 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa12.04□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 TNFSF18Q9UNG2 199 aa12.04□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 A0A1W2PPV4 95 aa12.03□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 RNF222A6NCQ9 220 aa12.03□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 G3V3Q6 166 aa12.03□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 ATP6V0CP27449 155 aa12.03□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 TCTAP57738 103 aa12.03□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 OR10G4Q8NGN3 311 aa12.03□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 OR10G9Q8NGN4 311 aa12.03□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 OR10G7Q8NGN6 311 aa12.03□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 LINC00477Q96M19 166 aa12.03□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 C20orf144Q9BQM9 153 aa12.03□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 APLNQ9ULZ1 77 aa12.03□□□□□ -0.48
KCNQ1-205ENST00000496887 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa12.02□□□□□ -0.49
KCNQ1-205ENST00000496887 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa12.02□□□□□ -0.49
KCNQ1-205ENST00000496887 H7BYZ3 331 aa12.02□□□□□ -0.49
KCNQ1-205ENST00000496887 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1411.2 ms