RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493468.6

PRPF40A-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRPF40A, Length 1,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-211ENST00000493468 OR5G3P0C626 314 aa9.56□□□□□ -0.88
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PRPF40A-211ENST00000493468 WFDC10BQ8IUB3 73 aa9.56□□□□□ -0.88
PRPF40A-211ENST00000493468 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PRPF40A-211ENST00000493468 VGLL1Q99990 258 aa9.56□□□□□ -0.88
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PRPF40A-211ENST00000493468 SYNGR2O43760 224 aa9.55□□□□□ -0.88
PRPF40A-211ENST00000493468 CT45A10P0DMU9 189 aa9.55□□□□□ -0.88
PRPF40A-211ENST00000493468 TCL1AP56279 114 aa9.55□□□□□ -0.88
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PRPF40A-211ENST00000493468 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
PRPF40A-211ENST00000493468 CD300CQ08708 224 aa9.47□□□□□ -0.89
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PRPF40A-211ENST00000493468 OR4E1P0C645 316 aa9.46□□□□□ -0.9
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