RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	HRH4	Q9H3N8	390 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMPX	Q9UHP9	88 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1B0GUS0	222 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF320	A2RRD8	509 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00862	A6NCI5	91 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266		A8MWP6	167 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266		K7EMT4	169 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	LGALS9	O00182	355 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	COX7A2P2	O60397	106 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR10J4	P0C629	311 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	HLA-DMB	P28068	263 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	GCHFR	P30047	84 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	MYCNOS	P40205	109 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB5C	P51148	216 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB31	Q13636	194 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF2	Q99496	336 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	MLX	Q9UH92	298 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNHD1	Q96M86	4753 aa		4.59	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	GGTLC3	B5MD39	225 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	SOCS3	O14543	225 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	VCY	O14598	125 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	MB	P02144	154 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	FOLR2	P14207	255 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	CBLN1	P23435	193 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	DEFB1	P60022	68 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	RHOB	P62745	196 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPEL1	Q2QD12	228 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD5	P06127	495 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	FABP1	P07148	127 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZP3	P21754	424 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATP5G3	P48201	142 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD81	P60033	236 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	HAGH	Q16775	308 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	PFDN5	Q99471	154 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	PAXX	Q9BUH6	204 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR51M1	Q9H341	326 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	RABAC1	Q9UI14	185 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A087X0K7	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1W2PPV4	95 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM74A7	A6NL05	159 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266		M0R3E3	92 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	OVOL1	O14753	267 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR7C2	O60412	319 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	GAGE7	O76087	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	CXorf1	O96002	111 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADCYAP1	P18509	176 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBE2G2	P60604	165 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	GNG5	P63218	68 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	GAGE1	Q13065	139 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	GAGE4	Q13068	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	DCANP1	Q8TF63	244 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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