RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490653.1

PRPF4B-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF4B, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-208ENST00000490653 TCTAP57738 103 aa5.17□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 SELENOTP62341 195 aa5.17□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 RHOBP62745 196 aa5.17□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 VAMP2P63027 116 aa5.17□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 OPCMLQ14982 345 aa5.17□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa5.17□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 LINC00305Q7Z4B0 112 aa5.17□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 NRARPQ7Z6K4 114 aa5.17□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 OR8A1Q8NGG7 326 aa5.17□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa5.17□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa5.17□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 MGAT4CQ9UBM8 478 aa5.17□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa5.17□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa5.16□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 H0YIZ8 118 aa5.16□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 RPL7P18124 248 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 CAV2P51636 162 aa5.16□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 NHLH2Q02577 135 aa5.16□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF846Q147U1 533 aa5.16□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 RRN3P1Q2M238 152 aa5.16□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 GCSAMLQ5JQS6 135 aa5.16□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM252Q8N6L7 170 aa5.16□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 LRRC20Q8TCA0 184 aa5.16□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 GPR82Q96P67 336 aa5.16□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 LINC01587Q99440 93 aa5.16□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 CCDC32Q9BV29 185 aa5.16□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa5.16□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF586Q9NXT0 402 aa5.16□□□□□ -1.58
PRPF4B-208ENST00000490653 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa5.15□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 J3KRW8 73 aa5.15□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 COX7A2P2O60397 106 aa5.15□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 AMBPP02760 352 aa5.15□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 CT45A10P0DMU9 189 aa5.15□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 HTN1P15515 57 aa5.15□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 CAMLGP49069 296 aa5.15□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 S100A10P60903 97 aa5.15□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 ERCC8Q13216 396 aa5.15□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 C10orf113Q5VZT2 155 aa5.15□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM88Q6PEY1 159 aa5.15□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 POM121L12Q8N7R1 296 aa5.15□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM208Q9BTX3 173 aa5.15□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 NDUFAF3Q9BU61 184 aa5.15□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 GGACTQ9BVM4 153 aa5.15□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 OR5AC2Q9NZP5 309 aa5.15□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 WDR83OSQ9Y284 106 aa5.15□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 NACAE9PAV3 2078 aa5.15□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa5.14□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM189A5PLL7 270 aa5.14□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa5.14□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 RTL8CO15255 209 aa5.14□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP5.14□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 IGLC2P0DOY2 106 aa5.14□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 DEFB130BP0DP73 79 aa5.14□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 DEFB130AP0DP74 79 aa5.14□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 DAD1P61803 113 aa5.14□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 ASAH1Q13510 395 aa5.14□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 FHL2Q14192 279 aa5.14□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 VWC2Q2TAL6 325 aa5.14□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 Q6ZQT7 251 aa5.14□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF546Q86UE3 836 aa5.14□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC39A9Q9NUM3 307 aa5.14□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 UQCC1Q9NVA1 299 aa5.14□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 M0R3E3 92 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 UPK1BO75841 260 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 NDUFB4O95168 129 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 INSP01308 110 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 PYYP10082 97 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 FGF7P21781 194 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 RPL29P47914 159 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 SULT1A1P50225 295 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 B2MP61769 119 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 BAXQ07812 192 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 OXA1LQ15070 435 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 PXDC1Q5TGL8 231 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 GFI1BQ5VTD9 330 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 SAMD13Q5VXD3 122 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 MIR17HGQ75NE6 70 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 C11orf21Q9P2W6 132 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 PXMP4Q9Y6I8 212 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa5.12□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 F5H768 121 aa5.12□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa5.12□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 P0DMU3 169 aa5.12□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM231AP0DMU4 169 aa5.12□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM231CP0DMU5 169 aa5.12□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 S100A7P31151 101 aa5.12□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 S100A11P31949 105 aa5.12□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 CDKN1BP46527 198 aa5.12□□□□□ -1.59
PRPF4B-208ENST00000490653 TAS2R60P59551 318 aa5.12□□□□□ -1.59
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