RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489910.1

LGR4-204, Transcript of leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 4, human

TSL 3

Gene LGR4, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LGR4-204	ENST00000489910	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	LINC01619	G3V211	115 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910		K7EMT4	169 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	LGALS9	O00182	355 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	CTSG	P08311	255 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	C8orf88	P0DMB2	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	ORM2	P19652	201 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	GALR1	P47211	349 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	GUK1	Q16774	197 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	TIGIT	Q495A1	244 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	CLLU1	Q5K131	121 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	FAM78B	Q5VT40	261 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	MIC13	Q5XKP0	118 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	FUT9	Q9Y231	359 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	ACAN	P16112	2415 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	F8	P00451	2351 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	IGKV1-17	P01599	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	IGHV3-11	P01762	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	PAFAH1B2	P68402	229 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	ATRAID	Q6UW56	229 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LGR4-204	ENST00000489910	PLXNB1	O43157	2135 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910		A8MWP6	167 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910		F6UZH7	168 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	OR7C2	O60412	319 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	IGHV3-48	P01763	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	IGHV3-23	P01764	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	MYCNOS	P40205	109 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	XG	P55808	180 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	PSG9	Q00887	426 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	ZNF90	Q03938	601 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	PDE6H	Q13956	83 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	PEA15	Q15121	130 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	OR11H1	Q8NG94	326 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	PAXX	Q9BUH6	204 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910		Q9HAA7	133 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	RPRM	Q9NS64	109 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	MED9	Q9NWA0	146 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	RAB19	A4D1S5	217 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910		H3BRN7	92 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910		I3L521	148 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	ZNF253	O75346	499 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	CRYBB3	P26998	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	CSN1S1	P47710	185 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	INSL3	P51460	131 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	LCN15	Q6UWW0	184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	C3orf56	Q8N813	242 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LGR4-204	ENST00000489910	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.2 ms